文献类型：会议

作　　者：窦文俊 李姝 彭占武 熊杰 亓宝 王琦

作者单位：[1]吉林农业大学食药用菌教育部工程研究中心 [2]吉林农业大学信息化中心 [3]中国科学院水生生物研究所

会议文献：中国菌物学会2023年学术年会论文摘要——菌物组学

会议名称：中国菌物学会2023年学术年会

会议日期：20230818

会议地点：中国贵州贵阳

出版日期：20230800

语　　种：中文

摘　　要：黏菌(Myxomycetes)是变形虫门下单系类群的真核生物,黏菌分布范围广泛,常见于温暖潮湿的森林生态系统中,主要捕食细菌、真菌,促进生态系统的碳和营养循环。由于黏菌的基因组杂合度高,存在许多短的串联重复序列所以尚未被成功组装出来,本研究结合前期团队对黏菌基因组大小估测以及黏菌与其内细菌关系的结果,通过高通量二代测序和Nanopore单分子测序技术,联合优化多种组装策略,成功构建了鳞钙皮菌Didymium squamulosum的高质量基因组,其基因组组装大小为98.65Mb,与盘基网柄菌Dictyostelium discoideum,紫网柄菌Dictyostelium purpureum等6种网柄菌物种预测的蛋白质序列进行基因家族聚类分析发现,共有基因家族1113个,共有基因11793个,其中单拷贝基因家族486个,特有基因家族有1886个,特有基因7224个,在鳞钙皮菌中受正选择基因为34个,同时还在鳞钙皮菌基因组中发现存在701条潜在水平基因转移的基因,占全部有GO注释基因的11.33%,这些基因主要来源于细菌、古菌、病毒、植物等。

关 键 词：鳞钙皮菌  基因组 基因家族 水平基因转移

分 类 号：Q949.3[植物生产类]