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粉尘螨Ⅰ类变应原成熟肽段基因的克隆和生物信息学分析
Cloning and Bioinformatics Analysis of the Gene Encoding Mature Peptide of Der fⅠ
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]皖南医学院变态反应研究所,芜湖241001
年 份:2008
卷 号:8
期 号:9
起止页码:889-892
语 种:中文
收录情况:CAB、CAS、RCCSE、UPD、WOS、ZGKJHX、ZR、普通刊
摘 要:目的了解不同地区粉尘螨Ⅰ类变应原(Der fⅠ)成熟肽段基因序列的变异性及其编码蛋白的化学及免疫学特征。方法从皖南地区分离鉴定的活粉尘螨,提取总RNA,采用RT-PCR扩增Der fⅠ成熟肽段基因,克隆到T载体测序确认。应用生物信息学软件对该基因进行初步分析。结果获得皖南地区两种不同基因型的Der fⅠ成熟肽段基因,与GenBank公布的其他地区Der fⅠ基因序列比较同源性在98.73%~99.84%之间;相应编码氨基酸序列的同源性在99.04%~100%之间,存在6个氨基酸残基变异位点,并影响其抗原表位的改变。结论不同地区Der fⅠ成熟肽段基因序列及其编码氨基酸序列存在差异,并对其免疫原性产生影响。克隆并分析研究我国各地的尘螨变应原基因序列及氨基酸序列变化,对于临床变应性疾病的诊治有重要的意义。
关 键 词:粉尘螨 Der fⅠ 基因克隆 生物信息学
分 类 号:R392.11]
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