期刊文章详细信息
基于16S rRNA部分序列探讨12种鲹科鱼类的分子系统进化关系
Molecular phylogenetic relationship of Carangidae based on partial sequence of mitochondrial 16S ribosomal RNA gene
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室,浙江宁波315211 [2]宁波大学生命科学与生物工程学院生物系,浙江宁波315211 [3]华南农业大学动物科学学院,广东广州510642
基 金:国家自然科学基金(30771652);华南农业大学校长基金(K06141)
年 份:2008
卷 号:32
期 号:6
起止页码:847-854
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2004、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:通过PCR扩增获得了中国海域的鲹科(Carangidae)8属9种的线粒体16S rRNA序列片段约598bp碱基,结合来自GenBank的3种鲹科鱼类的相应片段序列,并以大斑石鲈为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA version3.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比和转换/颠换值等,应用最大简约法和邻接法构建系统树。结果显示:(1)鲹科鱼类的16S rRNA序列片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入和缺失,共有146bp变异位点,转换/颠换值为2.17,表明基因序列的突变未达到饱和,碱基平均差异为8.22%;(2)支持鲹科下设四个亚科(鲹亚科,亚科,鲳鲹亚科,鲹亚科)阶元的分类系统;(3)鲹亚科鲹属下不宜设亚属分类阶元;(4)及达副叶鲹与丽叶鲹亲缘关系近,16S rRNA序列片段碱基只有1.07%的差异,未达到分属水平。
关 键 词:鲹科 线粒体DNA 16S RRNA序列 系统发育
分 类 号:S917[水产类]
参考文献:
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引证文献:
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同被引文献:
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