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正交设计优化果梅ISSR反应体系
Optimization of an ISSR reaction system of Japanese apricot (Prunus mume) based on orthogonal design
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]黔西南民族师范高等专科学校化学生物系,贵州兴义562400 [2]西南大学生命科学学院,重庆400715 [3]三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆400715 [4]仲恺农业技术学院农业与园林学院,广州510225
基 金:广东省科技计划项目(2007A020300002-6)
年 份:2009
卷 号:26
期 号:1
起止页码:108-112
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:以果梅(Prunus mume Sieb.et Zucc.)品种鸳鸯梅为试材,采用改良的CTAB法提取果梅嫩叶DNA,利用正交设计L16(4^5)探讨Mg^2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及模板DNA用量对果梅ISSR—PCR反应的影响,正交试验的结果采用直观分析和方差分析相结合。建立了果梅的ISSR—PCR优化反应体系,在20μL反应体系中含2μL 10×Buffer,2.5mmol·L^-2 Mg^2+,0.2mmol·L^-1 dNTPs,0.32μmol·L^-1引物,20—80ng模板DNA,0.75U Taq DNA聚合酶。在此基础上探讨了引物UBC840的最适退火温度、最佳循环次数及延伸时间,引物UBC840的最适退火温度为50.6℃。应用该优化反应体系,用2个不同引物对19份果梅资源DNA进行ISSR—PCR扩增,结果显示优化的反应体系具有较高的稳定性。
关 键 词:果梅 简单序列重复区间(ISSR) 正交设计 反应体系
分 类 号:S662.4]
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