期刊文章详细信息
用于检测仔猪致病菌的23S rRNA基因芯片的研制
Development of 23S rRNA gene-based microarray for detection of pathogenic bacteria in piglets
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]北京市农林科学院畜牧兽医研究所,北京100097 [2]江西生物科技职业学院,江西南昌330200 [3]河北农业大学动物科技学院,河北保定071000 [4]北京华大吉比爱生物技术有限公司,北京101300 [5]首都师范大学生命科学院,北京100037
基 金:北京市科技合同项目(Z0006321000191)
年 份:2010
卷 号:40
期 号:3
起止页码:258-264
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:以副猪嗜血杆菌、胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌、大肠杆菌、肠道沙门氏菌、猪链球菌等12种仔猪致病菌为目标细菌,23SrRNA基因为靶基因,从GenBank中下载其23SrDNA全序列,在其变异区设计特异性探针,在保守区设计通用引物。通过序列分析、PCR靶标与探针杂交试验,建立了有13条寡核苷酸探针和2对通用引物的仔猪常见致病菌基因芯片检测方法。以参考菌株粗提基因组DNA的10倍系列稀释模板做PCR,扩增产物与探针杂交,检出芯片的灵敏度为100fg。对33个参考菌株用芯片检测,结果有1例不正确,只鉴定到属;在61个野外分离株中,55株的芯片检测结果与生化或测序结果一致,有6例不一致,符合率为90%。初步研究证明,该检测方法能快速、有效地鉴定多种仔猪常见致病菌,但要区分某些细菌的致病株与非致病株,还要检测毒力/毒素基因。
关 键 词:仔猪 致病菌 23S RRNA基因 芯片 寡核苷酸探针
分 类 号:S858.25] Q81[动物医学类]
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