期刊文章详细信息
广西茶树地方品种遗传多样性和遗传结构的EST-SSR分析 ( EI收录)
Genetic Diversity and Structure of Tea Landraces from Guangxi Based on EST-SSR Analysis
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]中国农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心,杭州310008 [2]漳州天福茶职业技术学院,漳州363202 [3]广东省农业科学院茶叶研究所,广州510640
基 金:国家"863"计划(2006AA10Z171);国家茶叶产业技术体系(nycytx-026);国家自然科学基金(30901159);"十一五"国家科技支撑计划(2006BAD13B06);公益性行业(农业)科研专项(3-35);浙江省自然科学基金(Y3090041;Y3100291)
年 份:2011
卷 号:47
期 号:3
起止页码:59-67
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2008、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2011_2012、EI、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:利用设计合成的60对扩增稳定的EST-SSR核心引物分析51份广西茶树地方品种的遗传多样性和遗传结构,共检测到232个等位基因,每对引物检测到2~7个,平均3.88个。群体的观测杂合度(Ho)变化范围为0.02(TM149)~0.92(TM186),平均为0.37;期望杂合度(He)的变化范围为0.13(TM144,TM147)~0.73(TM189),平均为0.47;位点的多态信息含量(PIC)介于0.12~0.68之间,平均为0.41。地区间遗传相似系数在0.83~0.94之间,说明不同地区地方品种间的亲缘关系较近。对于茶与白毛茶群体而言,平均遗传分化系数为0.02(P<0.001),即有2%的遗传变异存在于群体间,而有98%的遗传变异存在于群体内。另外,种群内的近交系数Fis平均为0.21,说明群体内近交现象较严重。基于Nei’s遗传距离,利用PowerMarker3.25软件进行Neighbor-Joining聚类分析,将51份地方品种聚为3类:桂林、来宾和贺州的大部分品种,钦州和梧州的全部品种聚在第Ⅰ类;第Ⅱ类包含多数地区的品种;第Ⅲ类主要由崇左、防城港和南宁的品种组成。该结果与基于模型的遗传结构分析结果基本一致。
关 键 词:茶树 遗传多样性 遗传结构 EST-SSR
分 类 号:S718.46[林学类]
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