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用实时荧光定量PCR检测NAT2基因型及其意义
Analysis of the NAT2 genotypes with real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction and its significance
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]深圳市第三人民医院内科,518020 [2]深圳市第三人民医院肝病研究所,518020 [3]深圳市第三人民医院科教科,518020 [4]复旦大学生命科学院遗传学系
年 份:2011
卷 号:34
期 号:9
起止页码:842-848
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的探讨深圳地区汉族人中NAT2基因分布特征,为开展NAT2基因与肿瘤相关性研究和药物代谢性疾病诊治提供依据。方法将DNA浓度为40ng/μl的标本进行1×10^0、1×10^1×10^2、1×10^3、1×104倍比梯度稀释,以验证实时荧光定量PCR检测NAT2基因的灵敏度。采用实时荧光定量PCR结合TaqMan探针技术检测554名深圳汉族健康人NAT2基因282、341、481、590和857突变位点,并进行基因分型。同时用直接测序法对47名健康人标本进行平行检测,以验证和评价荧光定量PCR检测NAT2基因的敏感度、特异度和准确性。结果经倍比梯度稀释试验验证实时荧光定量PCR检测NAT2基因的灵敏度可精确至10^-4ng/μl。采用实时荧光定量PCR从554名深圳汉族人中检出NAT2^*4、*5、*6、*7、*11等位基因频率分别为64.6%(358/554)、6.3%(35/554)、25.3%(140/554)、30.0%(166/554)、0.6%(3/554)。主要基因型NAT2*4/*6、*6/*7、*13/*13或*12/*12或*4/*4、*4/*7、*7/*13、*12、*6/*13(*12)频率依次为12.3%(68/554)、8.3%(46/554)、7.6%(42/554)、40.5%(224/554)、8.1%(45/554)、7.2%(40/554)、5.6%(31/554),7种基因型约占总基因型的89.6%(496/554)。深圳地区汉族人中NAT2基因主要等位基因为*4、*6、*7、*13,表型以快乙酰化型和中间型为主,分别占40.5%(224/554)、46.7%(259/554),慢乙酰化型仅占12.8%(71/554)。用荧光定量PCR和直接测序法平行检测47名健康人NAT2基因,与直接测序法比较,检测282、341、481、590、857位点的敏感度分别为88.2%(30/34)、87.5%(7/8)、80.0%(4/5)、100.0%(22/22)、93.8%(15/16),特异度分别为100.0%(13/13)、94.9%(37/39)、100.0%(42/42)、96.0%(24/25
关 键 词:芳基胺N-乙酰转移酶 多态性,单核苷酸 聚合酶链反应
分 类 号:R450]
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