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Ptgs2基因在BXD重组近交系小鼠海马组织中的遗传基因组学分析
Genetic genomics analysis of Ptgs2 gene in the hippocampus of BXD recombinant inbred mice
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]南通大学医学院组织学与胚胎学系,226001
基 金:国家自然科学基金(30971591);江苏高校优势学科建设工程资助项目;南通大学自然科学资助项目(09Z033;10ZY008)
年 份:2011
卷 号:37
期 号:20
起止页码:2363-2365
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2008、CAS、CSCD、CSCD_E2011_2012、JST、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的研究前列腺素内过氧化物合酶(Ptgs)2基因在BXD重组近交系(RI)小鼠海马组织中的基因表达变化及表达调控。方法使用基因芯片检测BXD RI小鼠海马组织的基因表达。应用遗传基因组学研究方法进行基因表达数量性状基因座(eQTL)定位分析,寻找Ptgs2基因的上游调控位点、下游调控基因以及协同作用的基因。结果 Ptgs2基因在BXD RI小鼠海马组织中特异性高表达,且控制该基因的eQTL为顺式eQTL,该区域同时还是反式eQTL的富集区,偏相关系数分析发现其中有8个基因为Ptgs2基因的下游调控候选基因。皮尔森相关系数分析显示,BXD RI小鼠基因组中有151个基因与Ptgs2密切相关,其中前20个基因与Ptgs2的遗传相关度到达0.59以上。结论遗传基因组学研究能够有效筛选出Ptgs2基因的上游调控位点、下游调节基因及与之高度协同作用的基因,这部分基因是深入研究Ptgs2基因在多种精神类疾病中分子机制的重要靶点。
关 键 词:前列腺素内过氧化物合酶2 BXD重组近交系小鼠 基因表达数量性状基因座
分 类 号:R394]
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