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期刊文章详细信息

木本植物全基因组测序研究进展    

Progress on whole genome sequencing in woody plants

  

文献类型:期刊文章

作  者:施季森[1] 王占军[1] 陈金慧[1]

机构地区:[1]南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室,南京210037

出  处:《遗传》

基  金:国家自然科学基金重点项目(编号:30930077);国家自然科学基金青年项目(编号:30901156);国家林业局948引进项目(编号:2009-4-24);江苏高校自然科学基金项目(编号:09KJA220001);江苏省高校优势学科建设工程项目(PAPD)资助

年  份:2012

卷  号:34

期  号:2

起止页码:145-156

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2011_2012、EMBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘  要:近年来,植物全基因组测序的结果正如雨后春笋般涌现,木本植物全基因组测序也在紧锣密鼓地展开。但由于木本植物通常基因组较大,基因组结构较为复杂,在测序、测序后的组装、注释、功能分析等均存在较大的困难。在基因组测序分析的经费预算方面也存在着较大的压力。因此,有必要对这方面的研究进展及其存在问题进行分析比较,以提高林木全基因组研究方面的效率。文章在比较分析已经发展起来的3代基因测序技术(Sanger测序法、合成测序法和单分子测序法)的基础上,选择4种已经公布的木本植物(杨树、葡萄、番木瓜、苹果),从全基因组测序的研究背景、测序结果及应用的研究进展和存在问题等方面进行了述评,对未来要开展的木本植物全基因组测序前的准备工作(材料选择、遗传图谱和连锁图谱的构建、测序技术的选择),全基因组测序结果的生物信息学分析和应用进行了讨论。

关 键 词:木本植物 测序技术 全基因组

分 类 号:Q943.2[植物生产类]

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同被引文献:

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