期刊文章详细信息
柠檬明串珠菌及相近种部分持家基因的系统发育分析
Phylogenetic analysis of closely related Leuconostoc citreum species based on partial housekeeping genes
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,呼和浩特010018 [2]内蒙古大学生命科学学院生物学基地班,呼和浩特010018
基 金:内蒙古自治区科技应用项目(20120242);农业部现代农业产业技术体系建设项目(CARS-37);内蒙古自然科学基金开放课题(20102010)~~
年 份:2013
卷 号:53
期 号:7
起止页码:669-676
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2011、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2013_2014、IC、JST、PROQUEST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:【目的】利用16S rRNA、dnaA、murC和pyrG基因分子标记研究Leuconostoc citreum(Leu.citreum)及相近种间的种系发育关系,并比较这些基因序列对Leu.citreum及相近种的区分能力。【方法】以分离自酸面团中的7株Leu.citreum为研究对象,以dnaA、murC和pyrG基因片段为标记,通过PCR扩增、测序,结合已公布的近缘种及亚种相应序列,计算遗传距离,构建系统发育树,并与16S rRNA基因进行比较。【结果】研究发现Leu.citreum及相近种间的dnaA、murC和pyrG基因构建的系统发育树拓扑结构与16S rRNA基因基本一致,区别在于相似性的不同,其分别为75.5%-97.2%、50.2%-99.7%、65.0%-99.8%和98.5%-100%。【结论】在Leu.citreum及相近种间的种系发育关系中,dnaA、murC和pyrG基因与16S rRNA基因系统进化关系都具有很好的一致性,但这三个持家基因的遗传距离显著高于16S rRNA基因。因此,采用dnaA、murC和pyrG基因可以用于Leu.citreum及相近种的分类鉴定。
关 键 词:柠檬明串珠菌 系统发育分析 16SRRNA基因 持家基因
分 类 号:Q939]
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