文献类型：期刊文章

作　　者：冯旭[1,2] 周宝森[1]

机构地区：[1]中国医科大学公共卫生学院流行病学教研室,辽宁沈阳110001 [2]沈阳医学院公共卫生学院卫生统计学教研室,辽宁沈阳110034

出　　处：《中华疾病控制杂志》

基　　金：国家自然科学基金(81272293)

年　　份：2015

卷　　号：19

期　　号：1

起止页码：93-95

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的对hsa-miR-487b进行靶基因的预测及功能分析,为进一步研究其功能提供线索。方法应用Pubmed和Google检索hsa-miR-487b相关文献,选择miRanda和Target Scan两种方法预测其靶基因,取其交集,合并已经实验证实的靶基因作为进一步生物信息学分析的基因集合,对此基因集合进行功能富集分析(GO分析)和Pathway分析。结果 hsa-miR-487b序列在各物种间高度保守;其预测靶基因富集于细胞增殖、转录调控、细胞内信号传导、膜转运、染色体的结构及修饰、基因表达调控、酪氨酸激酶活性等共16个生物学过程和功能上(P<0.05),富集于Erb B信号通路、MAPK信号通路、Fc epsilon RI信号通路、癌症信号通路等7个通路,以及甲状腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌、结直肠癌、急、慢性白血病这些疾病通路中(P<0.10)。结论 hsa-miR-487b可能参与肿瘤发生及预后的生物学过程,为进一步实验性研究提供了线索。

关 键 词：MIR 生物信息学 靶基因

分 类 号：R319[基础医学类] R394