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期刊文章详细信息

亚洲地区丙型肝炎病毒基因重组研究    

The research of hepatitis c virus gene reorganization in Asia

  

文献类型:期刊文章

作  者:张克英[1] 周林源[2] 杨晓江[3] 张鸿雁[4] 迟坤[5] 张统一[6] 尹敏红[7] 邵中军[8]

机构地区:[1]第四军医大学学员旅 [2]第四军医大学护理系 [3]南京陆军指挥学院院务部门诊部 [4]中国人民解放军95133部队医院 [5]中国人民解放军61886部队 [6]兰州军区临潼疗养院第二疗养区 [7]兰州大学第二医院 [8]第四军医大学军事预防医学系流行病学教研室

出  处:《兰州大学学报(医学版)》

基  金:国家自然科学基金项目(30972517)

年  份:2014

卷  号:40

期  号:4

起止页码:13-17

语  种:中文

收录情况:CAS、ZGKJHX、普通刊

摘  要:目的检测亚洲地区丙型肝炎病毒(HCV)基因重组事件,探讨其重组规律及重组病毒株的分布情况。方法收集Gen Bank中HCV病毒基因全序列1 192条,标记病毒分离地点并选出亚洲地区HCV序列296条,利用MEGA4.1软件对齐整理,参照参考序列去除空位。利用最大似然法构建进化树,划分HCV基因型,统计出亚洲地区HCV不同基因型的分布特征。运用RDP4.0软件检测HCV中的重组事件,统计基因型内与基因型间重组事件的发生规律。结果 1型为亚洲地区流行的主要基因型,共检测到重组序列22条。结论不同基因型HCV在亚洲各地区分布有差异。基因重组断点在HCV基因组中散在分布,可能影响HCV病毒学特性与临床特征。

关 键 词:丙型肝炎病毒 基因 重组  

分 类 号:R512.63]

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