文献类型：期刊文章

作　　者：杨杰[1] 王金权[2] 丁维俊[3] 李炜弘[3] 刘宏伟[4]

机构地区：[1]贵州省毕节医学高等专科学校,贵州毕节551700 [2]平凉医学高等专科学校,甘肃平凉744000 [3]成都中医药大学,四川成都610075 [4]上海伯豪生物技术有限公司,上海201203

出　　处：《中草药》

年　　份：2015

卷　　号：46

期　　号：8

起止页码：1216-1222

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSA、CSCD、CSCD2015_2016、EMBASE、IC、IPA、JST、RCCSE、RSC、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的识别当归Angelica sinensis根药用活性物质的基因序列,阐释当归次生代谢产物生物合成的遗传基础。方法从当归头、当归尾提取总RNA,质量鉴定合格后构建测序文库。测序文库检测合格后在Illumina Hi Seq 2000测序仪上完成双端测序。采用相关生物信息学方法分析当归根的转录组特性。结果采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序获得当归根转录组的66 431 540个原始短读序。用生物信息学方法从头组装并注释了30 432个功能基因序列(unigene)。应用Uniprot蛋白数据库进行序列相似性比对,当归功能基因序列主要分布于目前研究较深入的7种重要经济作物,如葡萄、蓖麻、毛果杨、大豆、苜蓿、拟南芥和烟草。研究发现,当归根表达的127、69、70、94个unigene分别映射到类苯基丙烷生物合成、N-聚糖生物合成、黄酮类化合物生物合成和叶酸生物合成等路径,可能参与药用活性物质阿魏酸、当归多糖、当归总黄酮和叶酸的生物合成。结论参与当归根重要药效物质(阿魏酸、当归多糖、当归总黄酮等)生物合成的功能基因序列可能是当归补血、活血功效的分子生物学基础。

关 键 词：ILLUMINA HiSeq  2000高通量测序  采收期 当归根  转录组特性  次生代谢 当归多糖 阿魏酸  

分 类 号：R282.12[中药学类]