文献类型：期刊文章

作　　者：张军毅[1,2] 朱冰川[1] 徐超[1] 丁啸[2] 李俊锋[3] 张学工[3] 陆祖宏[2,4]

机构地区：[1]无锡市环境监测中心站,江苏无锡214121 [2]东南大学生物科学与医学工程学院生物电子学国家重点实验室,南京210096 [3]清华大学信息科学技术学院生物信息学教育部重点实验室/合成与系统生物学研究中心,北京100083 [4]北京大学工学院,北京100871

出　　处：《应用生态学报》

基　　金：江苏省环境监测科研基金项目(1320);国家自然科学基金项目(61227803);2013年江苏省普通高校研究生科研创新计划项目(CXLX13_114)资助

年　　份：2015

卷　　号：26

期　　号：11

起止页码：3545-3553

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、EMBASE、GEOBASE、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：随着新一代DNA测序技术出现,人们能够同时对多个DNA样本的宏基因组进行并行分析,尤其是以16S rRNA基因高变区为分子标记的测序已经成为微生物多样性研究最为简洁有效的方法.目前二代高通量测序的读长不能覆盖16S rRNA基因的全长,需要选择一个有效的高变区进行测序.十多年来,对于16S rRNA基因高变区的选择策略没有统一的标准.本文分析了常用的高变区选择策略,指出不同环境条件是影响高变区选择的重要因素之一.在此基础上,提出了高变区选择的参考准则,同时建议应对选择的高变区进行有效评估.

关 键 词：微生物多样性 16S  RRNA 新一代测序技术  选择策略  

分 类 号：Q78]