文献类型：期刊文章

作　　者：王潇[1] 尹天舒[1] 李柏逸[1] 江熹霖[1] 孙慧[1] 窦亚光[1] 倪琦[1] 田卫东[1,2]

机构地区：[1]复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系,上海200438 [2]复旦大学附属儿科医院,上海201102

出　　处：《中国科学：生命科学》

基　　金：国家自然科学基金(批准号:91231116;31071113;30971643);国家重点基础研究发展计划(批准号:2012CB316505;2010CB529505)资助

年　　份：2016

卷　　号：46

期　　号：4

起止页码：363-373

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、CSCD、CSCD2015_2016、JST、PUBMED、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段,对于揭示生物医学分子机制具有重要意义.目前已有上百种基因功能富集分析的方法和工具.根据所解决的问题和算法的原理,这些方法可大体分为过代表分析、功能集打分、基于通路拓扑结构和基于网络拓扑结构4大类.本文对这4大类方法的原理及其中的典型方法进行了综述,并讨论了基因功能富集分析结果的冗余性问题及建立标准数据集的必要性.

关 键 词：组学数据  功能富集  冗余性 标准数据集  

分 类 号：Q811.4[生物工程类]