文献类型：期刊文章

作　　者：侯玉臻[1,2] 赵丹彤[3] 刘国英[3] 贺番[4] 刘斌[1,2] 付绍印[5] 郝永清[6] 张文广[1,2,7]

机构地区：[1]内蒙古农业大学动物科学学院,呼和浩特010018 [2]动物遗传育种与繁殖内蒙古自治区重点实验室,呼和浩特010018 [3]金宇保灵生物药品有限公司,呼和浩特010018 [4]集宁师范学院生物系,乌兰察布012000 [5]内蒙古自治区农牧业科学院,呼和浩特010031 [6]内蒙古农业大学兽医学院,呼和浩特010018 [7]内蒙古ATCG生物信息研究所,呼和浩特010020

出　　处：《病毒学报》

基　　金：内蒙古"草原英才"工程专项资金(项目号:10803)

年　　份：2016

卷　　号：32

期　　号：3

起止页码：316-323

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2014、BIOSISPREVIEWS、CAB、CAS、CSCD、CSCD2015_2016、IC、JST、PUBMED、RCCSE、SCOPUS、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：本研究基于高通量测序技术对感染猪瘟兔化弱毒株(C株)后0h,12h,24h,30h,36h,48h的家兔脾脏组织进行测序,以家兔基因组作为参考,筛选感染后各时间点和对照组(0h)之间的差异基因。利用Uniprot和NCBI数据库查找各组中变化水平显著的前10个差异基因的生物学功能。结果发现,感染后12h,24h,30h的前10个差异基因只有少数与炎症、免疫、凋亡等相关;感染后36h,48h的前10个差异基因完全相同,其中B2M、RLA-DR-ALPHA、CD74和IGJ参与抗病毒过程。GO功能注释结果显示:感染后各时间点的差异基因都和免疫、代谢、调控途径紧密相关。KEGG通路富集分析发现,感染后24h的差异基因富集到RIG-I样受体信号通路,感染后30h的差异基因富集到黏着斑和细胞外基质-受体相互作用通路,感染后36h和48h的差异基因共同富集到的通路有20个,其中蛋白酶体,溶酶体,核糖体,趋化因子信号通路,B细胞受体信号通路,抗原加工提呈通路和FcγR介导的吞噬通路与抗病毒相关。本研究建立的家兔感染C株后脾脏组织的差异表达基因数据库,将为进一步阐述家兔适应C株的分子机制奠定基础。

关 键 词：猪瘟兔化弱毒株  家兔脾脏  转录组分析  

分 类 号：S852.65]