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期刊文章详细信息

聚苹果酸生产菌株出芽短梗霉菌代谢组学样品前处理方法的优化    

Optimization of Sample Pretreatment Method for Metabolomics Studies of Aureobasidium pullulans Producing Polymalic Acid

  

文献类型:期刊文章

作  者:范栩嘉[1] 边艳慧[1] 殷海松[2,3] 乔长晟[1,4]

机构地区:[1]天津科技大学生物工程学院工业发酵微生物教育部重点实验室,天津300457 [2]天津现代职业技术学院生物工程学院,天津300350 [3]天津市轻工业化学研究所有限公司,天津300350 [4]天津北洋百川生物技术有限公司,天津300457

出  处:《生物技术通报》

基  金:天津市科技支撑计划重点项目(14ZCZDTG00025)

年  份:2016

卷  号:32

期  号:6

起止页码:54-59

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAS、CSCD、CSCD_E2015_2016、ZGKJHX、核心刊

摘  要:为了得到更加准确和完整的胞内代谢物信息,从而更加真实的反映微生物胞内代谢情况,基于GC-MS平台,从淬灭剂、提取剂和溶解剂3个方面对代谢组学样品制备过程进行了系统性的优化。对比了不同淬灭剂对胞内代谢物的渗出及细胞损伤情况,结果表明60%甲醇/0.9%Na Cl效果最佳。研究了不同提取剂、溶解剂的提取和溶解效果,结果显示60%甲醇提取效果显著,吡啶溶解效果突出。最终确定了出芽短梗霉菌代谢组样品最适前处理方法 :预冷的60%甲醇/0.9%Na Cl淬灭细胞,液氮研磨和反复冻融破碎细胞,预冷的60%甲醇提取,最后采用吡啶溶解提取物并采用MSTFA 40℃衍生90 min。采用该方法可以检测出300多种代谢组分,包括大量氨基酸、有机酸和糖类物质。本方法可以有效的应用于出芽短梗霉菌代谢组学样品的研究。

关 键 词:代谢组学 出芽短梗霉 GC-MS 样品前处理

分 类 号:Q936]

参考文献:

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耦合文献:

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引证文献:

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同被引文献:

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