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期刊文章详细信息

结核分枝杆菌调节蛋白RelA结构和功能的生物信息学分析    

Bioinformatics analysis of the structure and function of the regulatory protein RelA of Mycobacterium Tuberculosis

  

文献类型:期刊文章

作  者:宋通[1] 付玉荣[2] 伊正君[1]

SONG Tong FU Yu-rong YI Zheng-jun(Department of Medical Laboratory Science, Weifang Medical University, Weifang 261033, Shandong , China Department of Pathogen Biology, Wei fang Medical University)

机构地区:[1]潍坊医学院医学检验学系,山东潍坊261053 [2]潍坊医学院病原生物学教研室

出  处:《中国病原生物学杂志》

基  金:国家自然科学基金项目(No.30972639);山东省自然科学基金项目(No.ZR2016HM09)

年  份:2017

卷  号:12

期  号:5

起止页码:402-406

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2014、CAB、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的应用生物信息学方法分析预测结核分枝杆菌调节蛋白RelA的结构及功能。方法从NCBI数据库获取结核分枝杆菌RelA蛋白的氨基酸序列,采用ProtParam工具预测蛋白质理化性质,采用Predict-Protein工具预测二级结构和疏水性,采用TMHMM软件包和TMpred程序对跨膜区预测,采用SignalP 4.1Server,用神经网络模型对信号肽预测,分析亚细胞定位、结构域和功能,运用SWISS-MODEL工具在线预测三维结构等。结果结核分枝杆菌RelA蛋白含有894个氨基酸,为不稳定性疏水性分泌蛋白,二级结构以螺旋结构和环状结构为主,无跨膜区,包含5个保守域,在胞浆中发挥生物学效应,调节(p)ppGpp合成。结论结核分枝杆菌RelA基因编码蛋白为不稳定性疏水性分泌蛋白,作为调节蛋白,主要参与细菌在生存压力下引起的严紧反应,调节(p)ppGpp的合成,因此可作为抗结核潜伏、持续感染治疗靶点。

关 键 词:结核分枝杆菌 RelA蛋白  严紧反应  潜伏结核感染 结构  

分 类 号:R378.91]

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