文献类型：期刊文章

作　　者：胡挺松[1] 张海林[1] 刘永华[2] 徐松淼[1] 李华昌[3] 邓波[1] 尹小雄[2] 黄瑛[4] 张富强[1] 范泉水[1]

HU Ting-song ZHANG Hai-lin LIU Yong-hua XU Song-miao YIN Xiao-xiong LI Hua-chang DENG Bo HUANG Ying ZHANG Fu-qiang FAN Quan-shui(Center for Disease Control and Prevention, Chengdu Military Region, Kunming 650118, China Ruili Center for Disease Control and Prevention, Ruili 678600, China Lincang Prefecture Center for Disease Control and Prevention, Lincang 677000, China The Third People＇s Hospital of Kunming , Kunming 650041, China)

机构地区：[1]成都军区疾病预防控制中心,昆明650118 [2]瑞丽市疾病预防控制中心,瑞丽678600 [3]临沧市疾病预防控制中心,临沧677000 [4]昆明市第三人民医院,昆明650041

出　　处：《中国人兽共患病学报》

基　　金：国家十三;五重大专项(No.2016YFC1200100);全军青年培育项目(15QNP035);中国博士后基金(No.2015M582907;2016T91009)联合资助~~

年　　份：2017

卷　　号：33

期　　号：6

起止页码：473-480

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2014、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的阐明云南省中缅边境地区2013-2015年14株登革1型病毒(DENV-1)全基因组序列特征。方法采用C6/36细胞培养法分离病毒,用RT-PCR法扩增新分离DENV-1的全基因组序列,采用ClastalX1.83和MEGA6等生物信息学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列同源性及系统进化分析。结果从登革热患者血清中分离到14株DENV-1,其中瑞丽市9株,临沧市3株,昆明市2株。经RT-PCR和序列测定,获得这14株DENV-1的全基因组序列(10 735nt),其开放读码框(95-10 271)编码3 392个氨基酸。系统进化和同源性分析表明,13株为基因I型(G-I),其中瑞丽和临沧本地病例7株,缅甸输入性病例6株;1株为G-III(昆明的印度输入性病例)。云南13株G-I可分为2个进化群,但均与缅甸、泰国等东南亚流行株具有较近的亲缘关系。云南13株G-I的E基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.02%-100%和98.78%-100%,它们与6株东南亚G-I参考株的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.53%-99.53%和97.33%-100%,与DENV-1原型株US_Hawaii核苷酸和氨基酸同源性分别为93.76%-94.45%和95.86%-96.91%。所有云南株和东南亚参考株与US_Hawaii株在结构蛋白或非结构蛋白的氨基酸位点分别存在44和150个位点差异。结论云南中缅边境地区2013-2015年流行的DENV-1均为G-I,并具有基因多样性特点但均为来自缅甸的多个传播来源。

关 键 词：登革1型病毒  全基因组 系统进化分析 同源性分析 氨基酸位点分析  

分 类 号：R373.3]