文献类型：期刊文章

作　　者：王位[1,2] 付绍印[2,3,4] 何小龙[3] 王艳欣[1,2] 王月星[1,2] 王标[3] 刘斌[2,5] 刘永斌[3] 张文广[1,2]

机构地区：[1]内蒙古农业大学动物科学学院,呼和浩特010018 [2]动物遗传育种与繁殖内蒙古自治区重点实验室,呼和浩特010018 [3]内蒙古自治区农牧业科学院,呼和浩特010031 [4]内蒙古ATCG生物信息研究所,呼和浩特010020 [5]内蒙古犇牛科技有限公司,呼和浩特010020

出　　处：《中国畜牧兽医》

基　　金：国家自然科学基金项目(31360542); 内蒙古自治区农牧业科学院青年创新基金(2015QNJJM04); 国家肉羊产业技术体系建设项目(CARS-39)

年　　份：2018

卷　　号：45

期　　号：1

起止页码：122-130

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CAS、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：试验通过对小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌进行转录组分析,旨在挖掘影响两种绵羊肉质性状的关键基因。分别选取小尾寒羊和巴美肉羊各3只,利用转录组高通量测序(RNA-Seq)技术对其背最长肌转录组文库进行测序,利用生物信息学对测序结果进行分析,筛选影响两者肉质相关的候选基因。结果发现,6个样品测序数据经质量控制后共得到120Gb的有效数据,共筛选出333个差异基因,其中上调基因有82个,下调基因有251个。GO功能富集与KEGG Pathway显著性富集分析结果共筛选了6个与肉质性状相关的候选基因:PDK4、MYF6、PPARGC1A、SLCO4A1、FABP4、LEP。试验通过对比小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌转录组数据,筛选影响肉质性状的候选基因,丰富了绵羊基因组信息,为进一步阐述不同品种绵羊肉质性状分子机理奠定了基础。

关 键 词：RNA-SEQ 肉质性状 转录组 小尾寒羊 巴美肉羊  背最长肌

分 类 号：S813.3]