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MALDI-TOF MS与16SrDNA方法对肠杆菌科微生物鉴定比较分析 ( EI收录)
Analysis and Comparison of MALDI-TOF MS and 16SrDNA for the Identification of Enterobacteriaceae
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]四川省农科院分析测试中心,四川成都610066 [2]华西师范大学生命科学院,四川南充637009
基 金:国家农产品质量安全风险评估重大专项(GJFP201601302)资助
年 份:2018
卷 号:39
期 号:2
起止页码:209-215
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、EI、JST、RSC、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了研究基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)法鉴定肠杆菌科微生物及其对微生物系统分类学相关分析的准确性,采用MALDI-TOF MS对金桔表面分离的10种肠杆菌科微生物进行蛋白质图谱收集,通过比对图谱特征峰实现微生物的鉴定与系统进化学分析;同时对10种微生物进行16SrDNA提取与测序,得到分子生物化学水平鉴定,并采用邻近连接法对16SrDNA序列做系统进化树分析。结果表明:MALDI-TOF MS与16SrDNA测序对10种肠杆菌科微生物鉴定结果中,克雷伯菌属2株菌鉴定种级有偏差,其他8种一致;MALDI-TOF MS与16SrDNA测得的数据都可计算微生物相关性,从而得到微生物系统发育树,两株系统发育树中同属级微生物归类的亲缘位置与方向一致,但不同属肠杆菌科微生物的亲缘距离与位置差异较大。MALDI-TOF MS法鉴定农产品表面微生物具有快速、准确的特点,但准确建立系统发育相关性还需要扩大数据库和优化算法。
关 键 词:基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS) 16SrDNA 肠杆菌科微生物 系统进化
分 类 号:O657.63]
参考文献:
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