期刊文章详细信息
结膜吸吮线虫基因组中分泌蛋白的规模预测及分析
Prediction and analysis for secretory proteins from Thelazia callipaeda at Genome Scale
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]遵义医学院,基础医学院,遵义563003 [2]遵义市公安局新蒲分局,遵义563003 [3]黔南民族医学院高等专科学校,都匀558000
基 金:国家自然科学基地区项目(81560336); 贵州省科技厅基金(黔科合基础[2016]1168); 贵州省教育厅创新团队(黔合教人才团队字[2014]39号)
年 份:2018
卷 号:34
期 号:1
起止页码:12-17
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:目的在对结膜吸吮线虫基因组数据进行注释的基础上对其中分泌蛋白进行规模预测及分析。方法联合应用SignalP、TMHMM、MEME、Protcomp、big-PI Predictor和SecretomeP等多种生物信息学软件进行分析,完成了结膜吸吮线虫分泌蛋白组的预测,对其进行GO功能富集、KEGG通路分析、结构域统计以及具有抗原性分泌蛋白预测等分析。结果结膜吸吮线虫含有约259个分泌蛋白,其长度多集中在100-700aa;GO功能分析发现这些分泌蛋白多富集在分泌途径及宿主互作中;KEGG分析显示分泌蛋白在药物及谷胱甘肽代谢中发挥着重要作用;候选分泌蛋白的结构域分析发现存在最多为糖水解酶结构域;大规模筛选预测到126个分泌蛋白具有B细胞表位抗原性的功能。结论结膜吸吮线虫分泌蛋白多为小型蛋白,推测这些蛋白可能参与糖代谢、抗氧化活性,协助虫体的入侵及其在宿主体内的寄生。
关 键 词:结膜吸吮线虫 分泌蛋白组 分泌蛋白 糖代谢
分 类 号:R383.1]
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