期刊文章详细信息
辣椒基因组中XTH基因家族的鉴定与表达特征分析
Identification and Expression Analysis of the XTH Gene Family in Pepper (Capsicum annuum L.)
文献类型:期刊文章
LI Ning1, SHEN Yao2, XIA Bibo2, LIANG Guansheng2, WU Zhiming2., LIU Haiqing3(1 Agriculture Bureau of Chengyang District in Qingdao, Qingdao, Shandong 266109, China 2 Horticulture and Landscape College, Zhongkai University of Agriculture and Engineering, Guaugzhou, Guaugdong 510225, China 3 Institute of Scienee and Technology Information, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Danzhou, Hainan 571737, Chin)
机构地区:[1]青岛市城阳区农业局,山东青岛266109 [2]仲恺农业工程学院园艺园林学院,广东广州510225 [3]中国热带农业科学院科技信息研究所,海南儋州571737
基 金:广东省自然科学基金项目(No.2014A030313593);广州市产学研协同创新重大专项-民生科技专项(No.201704020019);海南省科技合作专项资金"海南省辣椒作物基因型-表型数据深度挖掘技术研究与应用"(No.KJHZ2015-33)
年 份:2018
卷 号:39
期 号:2
起止页码:317-324
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CSCD、CSCD_E2017_2018、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为全面了解木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶(xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase,XTH)基因在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定出了所有辣椒XTH基因家族成员,并对基因的结构、染色体定位、系统进化关系和保守结构域等进行了预测,同时基于转录组数据集分析了XTH基因在辣椒不同器官、不同发育时期果实中的表达特征。结果表明,辣椒XTH家族包含23个基因成员,不均衡分布在除10号染色体外的其余11条染色体上;23个基因包含1~5个不等的内含子;系统进化分析表明,辣椒XTH蛋白可分为3个亚家族;基因表达特征分析显示,大多数辣椒XTH的表达具有组织特异性,CaXTH2、CaXTH21、CaXTH13和CaXTH23极有可能与辣椒果实的膨大与成熟相关。本研究为深入了解辣椒XTH基因的功能奠定了基础。
关 键 词:辣椒 木葡聚糖内转糖苷酶/水解酶 基因表达 果实发育与成熟
分 类 号:S641.3]
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