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重庆市萝卜芜菁花叶病毒的检测与序列分析
Detection and sequence analysis of CP gene of Turnip mosaic virus (TuMV) infecting radish plants in Chongqing City
文献类型:期刊文章
Xiong Yan;Sun Miao;Xiang Huafeng;Wang Hebing;Zhang Hongcheng;Qing Ling(Institute of Vegetables and Flowers, Chongqing Academy of Agricultural Sciences, Chongqing 401329, China;Chongqing Key Laboratory of Plant Disease Biology, College of Plant Protection, Southwest University, Chongqing 400716, China)
机构地区:[1]重庆市农业科学院蔬菜花卉所,重庆401329 [2]西南大学植物保护学院植物病害生物学重庆市高校级重点实验室,重庆400716
基 金:重庆市科技支撑示范工程项目(cstc2012jcsf-jfzhx0009);中央高校基本科研业务费专项资金(XDJK2017A006)
年 份:2018
卷 号:45
期 号:3
起止页码:432-438
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2017_2018、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:为明确重庆市萝卜感染芜菁花叶病毒(Turnip mosaic virus,TuMV)的情况,在重庆市巴南区、九龙坡区、北碚区等14个区县共采集了146份萝卜病毒病样品,采用酶联免疫吸附试验法(enzymelinked immunosorbent assay,ELISA)对病样进行TuMV检测,并通过PCR、克隆和测序等技术获得13个TuMV分离物CP核苷酸序列,利用软件分析重庆市TuMV CP基因序列的相似性,利用系统进化树分析CP基因遗传变异与系统进化。结果表明,共有105份样品的TuMV检测为阳性,检出率为71.9%;所得13个分离物CP基因均为864 bp,测序的13个分离物CP核苷酸相似性为89.1%~99.2%,与国内已报道的TuMV各分离物CP核苷酸相似性在88.3%~99.4%之间;所得的13个分离物均分布在basal-BR和world-B组中,在Asian-BR和basal-B组中均无分布,进一步分析发现有9个分离物属于word-B组,仅4个分离物属于basal-BR组。研究表明,TuMV在重庆市萝卜各种植区普遍发生,且word-B组为重庆市萝卜的优势毒源。
关 键 词:重庆市 萝卜 TUMV CP基因 系统进化分析
分 类 号:S436.31]
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