文献类型：期刊文章

作　　者：蔡苗[1,2] 孙新颖[3] 刘庆慧[1] 万晓媛[1] 黄倢[1]

CAI Miao;SUN Xin-ying;LIU Qing-hui;WAN Xiao-yuan;HUANG Jie(Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes,Qingdao National Laboratory for Marine Science and,Technology,Key Laboratory of Maricultural Organism,Disease Control,Ministry of Agriculture,Qingdao Key Laboratory of Mariculture Epidemiology and Biosecurity,Yellow Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy 〇 o Fishery Sciences,Qingdao 26607 1,China;National Demonstration Center yor Experimental Fisheries Science Education,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China;Frontier Science Research Institute,University of Jinan,Jinan 250022,China)

机构地区：[1]青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室农业部海水养殖病害防治重点实验室青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071 [2]水产科学国家级实验教学示范中心上海海洋大学,上海201306 [3]济南大学前沿交叉科学研究院,济南250022

出　　处：《海洋渔业》

基　　金：国家自然科学基金(31672679);国家重点基础研究发展计划(2012CB114401)

年　　份：2018

卷　　号：40

期　　号：4

起止页码：454-464

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2017_2018、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：为探究中国白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的分子流行病学变异情况,选取2016年1-7月从我国3省9市采集到的47份WSSV阳性样本,提取WSSV核酸后,使用特定引物对目的片段进行扩增,继而进行测序并分析比较不同地区样本的ORF14/15和ORF23/24序列缺失情况,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR及SNPs变化情况。结果显示,在ORF14/15的扩增中,有4种缺失片段,分别是6 540 bp、6 530 bp、5 950 bp和5 140 bp,而在ORF23/24扩增中则有3种大片段缺失,分别是12 073 bp、12 070bp和11 945 bp,在所有样本中ORF75的RUs数目分别为11、8、10、3,ORF94的RUs数目分别为5、7、8、11、14,ORF125的RUs数目为4、5、6。SNPs分析结果表明,ORF94片段中含有5个和8个RUs的在48位的碱基均为T,含有7个RUs的在48位的碱基为T、G、G、G、G、T、T,含有11个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、T、T、G、T、G、T、T,含有14个RUs的在48位的碱基为T、T、T、T、G、G、T、G、G、T、T、T、T、T,含有所有RUs数目的ORF125片段在8、18、25、66和69位置的碱基均为G、G、G、G和A,,而在9、50、53、61和63位的碱基则出现了4种变异。研究结果表明,2016年的样本中,WSSV毒株存在一定程度的变异情况。主要表现在ORF14/15和ORF23/24均出现了新的缺失片段,ORF75、ORF94和ORF125的VNTR以及SNPs变异情况也存在明显差异。

关 键 词：白斑综合征病毒 变异  缺失  单核苷酸多态性

分 类 号：S945.4]