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基于线粒体Cyt b和COⅠ基因序列的华南鲤群体遗传结构分析
Analysis of population genetic structure of Cyprinus carpio rubrofuscus based on mitochondrial Cyt b and COⅠ gene sequences
文献类型:期刊文章
机构地区:[1]华南农业大学海洋学院,广东广州510642 [2]广东省清远市水产技术推广站,广东清远511510 [3]清远市北江水产科学研究所,广东清远511510 [4]广东省清远市兴渔水产科技有限公司,广东清远511510
基 金:国家现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-46-43);华南农业大学青年科技人才培育专项(编号:201707N025);华南农业大学引进人才专项;华南农业大学海洋学院青年教师科研启动基金
年 份:2018
卷 号:46
期 号:18
起止页码:179-183
语 种:中文
收录情况:JST、RCCSE、ZGKJHX、普通刊
摘 要:运用线粒体Cyt b和COⅠ基因序列测定技术,分析华南鲤(Cyprinus carpio rubrofuscus Lacepede) 3个种群的群体遗传结构及其变异。结果表明,海南鲤、珠江鲤、榕江鲤平均遗传距离分别为0. 003 1(Cyt b)、0. 003 0(COⅠ); 52尾个体分别检测出13(Cyt b)、12(COⅠ)个单倍型,总群体单倍型多样性(Hd)分别为0. 874(Cyt b)、0. 770(COⅠ),核苷酸多样性指数(π)分别为0. 004 15(Cyt b)和0. 003 38(COⅠ),平均核苷酸差异数(K)分别为3. 027(Cyt b)和1. 835(COⅠ)。构建NJ系统进化树发现,各种群间未形成明显的谱系结构,未发现明显的地理结构。海南鲤与珠江鲤、榕江鲤的分化约在2. 50万、2. 65万年前,而珠江鲤和榕江鲤之间的的分化年代约在1. 50万年前。珠江鲤和榕江鲤的遗传分化指数差异不显著,2个种群间的交流更加频繁。
关 键 词:华南鲤 CYT B基因 COⅠ基因 群体遗传结构 遗传距离 多样性指数 分化年代
分 类 号:Q173]
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