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口蹄疫病毒实时荧光RT-RPA快速检测方法的建立
Development of the real-time reverse transcription recombinase polymerase amplification for rapid detection of foot-and-mouth disease virus
文献类型:期刊文章
LIU Li-bing;WANG Jin-feng;ZHANG Ruo-xi;SHI Rui-han;HAN Qing-an;LI Rui-wen;WANG Jian-chang;YUAN Wan-zhe(Hebei Academy of Science and Technology for Inspection and Quarantine, Shijiazhuang 050051, China;Center of Inspection and Quarantine, Hebei Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Shijiazhuang 050051, China;Hebei Animal Disease Control Center, Shijiazhuang 050035, China;College of Veterinary Medicine, Agricultural University of Hebei, Baoding 071001, China)
机构地区:[1]河北省检验检疫科学技术研究院,河北石家庄050051 [2]河北出入境检验检疫局技术中心,河北石家庄050051 [3]河北省动物疫病预防控制中心,河北石家庄050035 [4]河北农业大学动物医学院,河北保定071001
基 金:河北省自然科学基金青年项目(C2017325001);河北省现代农业羊产业体系项目编号(326-0710-JSNDDDC);河北省高校百名优秀创新人才支持计划(SLRC2017039);河北省高校百名优秀创新人才支持计划(Ⅲ)(SLRC2017039);河北省现代农业产业技术体系羊产业创新团队专项资金(HBCT2018140204)
年 份:2019
卷 号:41
期 号:2
起止页码:168-173
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:为建立一种简单、快速、特异的口蹄疫病毒(FMDV)分子检测方法,本研究基于FMDV的3D基因,设计特异性引物和exo探针,建立了用于FMDV快速检测的等温实时荧光反转录重组酶聚合酶(Real-time RT-RPA)方法。该方法采用便携式等温扩增仪-Genie Ⅲ实时监测扩增结果,40℃20 min即可完成检测。结果显示,FMDV RT-RPA方法能够特异性扩增FMDV 3D基因,而对水泡性口炎病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、脑心肌炎病毒等均无扩增;以体外转录的FMDV 3D RNA作为模板,该方法在95%置信区间检出下限为1.0×10~2拷贝/μL,组内和组间变异系数均小于1%;使用43份含有灭活FMDV的模拟临床样品分析显示,RT-RPA对FMDV的检出率为34.9%(15/43),略低于荧光定量RT-PCR的检出率(39.5%,17/43),而两种方法的符合率为95.3%(41/43)。RT-RPA能够在6 min~16 min内完成检测,而实时荧光RT-PCR则需要30 min~51 min。本研究所建立的实时荧光RT-RPA方法反应快速,特异性强,灵敏性高,操作简单,结合便携式具有荧光检测功能的等温扩增仪Genie Ⅲ,组建了FMDV快速检测平台,在基层兽医部门,尤其在野外及疫情现场的FMDV检测中具有极大的应用潜力,为设备仪器有限的实验室和田间对FMDV的快速检测提供了一种有效的方法,对于条件有限地区FMD的防控具有重要意义。
关 键 词:口蹄疫病毒 3D基因 exo探针 实时荧光RT-RPA
分 类 号:S852.65]
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