文献类型：期刊文章

作　　者：刘晓娉[1,2] 孙新颖[3] 刘庆慧[1] 万晓媛[1] 黄倢[1]

LIU Xiao-ping;SUN Xin-ying;LIU Qing-hui;WAN Xiao-yuan;HUANG Jie(Laboratory for Marine Fisheries Science and Food Production Processes, Qingdao National Laboratory for Marine Science and Technology, Key Laboratory of Maricultural Organism Disease Control, Ministry of Agriculture, Qingdao Key Laboratory of Mariculture Epidemiology and Biosecurity, Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Qingdao Shandong, China 266071;Shanghai Ocean University,Shanghai 201306;Jinan University Frontier Interdisciplinary Research Institute , Jinan Shandong 250022)

机构地区：[1]青岛海洋科学与技术国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室,农业部海水养殖病害防治重点实验室,青岛市海水养殖流行病学与生物安保重点实验室,中国水产科学研究院黄海水产研究所,山东青岛266071 [2]上海海洋大学,上海201306 [3]济南大学前沿交叉科学研究院,山东济南250022

出　　处：《海洋渔业》

基　　金：国家自然科学基金(31672679);国家重点基础研究发展计划(2012CB114401)

年　　份：2019

卷　　号：41

期　　号：3

起止页码：329-337

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2017、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PROQUEST、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊

摘　　要：白斑综合征病毒(WSSV)自暴发以来给全球范围内的对虾养殖产业带来了巨大的损失。为了解我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)养殖区WSSV的流行变异情况,选取2017年中国部分地区的42个WSSV阳性样本,对ORF14/15、ORF23/24、ORF75、ORF94和ORF125共5个可变区进行PCR特异性扩增,分析其序列的缺失变异和重复单元(Ru)中单核苷酸多态性的变化。研究结果显示,在ORF14/15的扩增中共出现4种缺失片段;ORF23/24只出现11945bp的缺失片段;ORF75扩增中,总RUs数目为3、4、9,其中45bp的RUs在12、27、80位点发生多核苷酸多态性;ORF94的RUs数目为6,其各重复单元在48位发生单核苷酸多态性;ORF125的RUs数目为4、6、7不等,其各重复单元分别在20、27、50、53、61位发生碱基突变。研究结果表明,2017年样本中,WSSV在中国大部分地区均出现一定程度的缺失变异,其中部分可变区表现出缺失情况的稳定性,某些可变区的重复单元数目及SNP表现出地区的差异性以及不稳定性。

关 键 词：WSSV ORF14/15  ORF23/24  ORF75  ORF94  ORF125  序列分析  

分 类 号：Q93-331]