期刊文章详细信息
5种类型鲤鱼线粒体DNA D-loop及邻近区段的遗传多样性分析
Genetic Diversity Analysis of Mitochondrial DNA D-loop and Its Adjacent Region in Five Types of Common Carp
文献类型:期刊文章
BAI Yun;WANG Yan;HU Ying;ZHANG Xinghua;JIN Wankun;GAO Yongping;YANG Jianxin;DONG Shi(College of Life Science,Tianjin Key Laboratory of Animal and Plant Resistance,Tianjin Normal University,Tianjin 300387,China;National Tianjin Huanxin Aquatic Thoroughbred Hatchery,Tianjin 301500,China)
机构地区:[1]天津师范大学生命科学学院,天津市动植物抗性重点实验室,天津300387 [2]国家级天津市换新水产良种场,天津301500
基 金:国家科技基础条件平台项目(2018DKA30470);天津市水产产业技术体系创新团队淡水鱼类遗传育种岗位项目(ITTFRS2017001);天津市水产产业技术体系创新团队淡水鱼类遗传育种试验站项目(ITTFRS2018043)
年 份:2019
卷 号:38
期 号:4
起止页码:498-505
语 种:中文
收录情况:AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2019_2020、FSTA、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNA D-loop及邻近区段进行了扩增,经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段,长度分别为1342、1343、1344 bp。共得到8种单倍型(GenBank序列号为MG786481~MG786483,MG786485~MG786487,KC292935,KC292936)。使用Mega 6.0软件计算出5个群体的组内及组间遗传距离,并构建邻接系统树。线粒体DNA D-loop及邻近区段、单独D-loop区段的碱基序列分析结果表明,单倍型Ⅰ至Ⅳ为欧洲血统,碱基差异位点数较多,变异程度较高;单倍型Ⅴ至Ⅷ为亚洲血统,碱基差异位点数较少,变异程度较低。在线粒体DNA D-loop及邻近区段内,德国镜鲤组内平均遗传距离为0.00462,核苷酸多样性指数为0.00458,平均核苷酸差异性为6.150,遗传多样性最大;州河鲤组内的平均遗传距离为0.00065,核苷酸多样性指数为0.00065,平均核苷酸差异性为0.870,遗传多样性最低。
关 键 词:乌克兰鳞鲤 德国镜鲤 框鳞镜鲤 红镜鲤 州河鲤 D-LOOP 遗传多样性
分 类 号:S917[水产类]
参考文献:
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