期刊文章详细信息
基于转录组测序的铁皮石斛黄酮代谢途径及相关基因解析
Transcriptome Analysis on Pathway of and Genes Related to Flavonoid Synthesis in Dendrobium officinale
文献类型:期刊文章
LIN Jiang-bo;WANG Wei-ying;ZOU Hui;DAI Yi-min(Subtropical Agriculture Research Institute,Fujian Academy of Agricultural Sciences,Zhangzhou,Fujian 363005,China)
机构地区:[1]福建省农业科学院亚热带农业研究所,福建 漳州 363005
基 金:福建省科技计划公益类专项(2018R1024-3)
年 份:2019
卷 号:34
期 号:9
起止页码:1019-1025
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、ZR、核心刊
摘 要:【目的】分析铁皮石斛Dendrobium officinale黄酮类化合物的生物合成途径及相关基因,为铁皮石斛黄酮类化合物代谢调控、药用价值的开发研究提供参考。【方法】利用Illumina HiSeq 4000测序平台对铁皮石斛2个生长阶段茎、叶进行高通量转录组测序,对组装获得的unigenes进行功能注释和黄酮类化合物的生物合成相关基因解析。【结果】铁皮石斛黄酮类化合物代谢相关Unigenes 48个,涉及14个酶。5个CHS相关Unigenes具有CHSlike保守结构域,活性位点氨基酸残基(Cys-His-Asn)高度保守,丙二酰辅酶A结合位点和产物结合位点的部分氨基酸残基发生变异。CHI(Unigene0013781)属于类型I查尔酮异构酶,异构化6′-羟基查尔酮为5-羟基黄烷酮。表达分析表明,2个生长时期的茎和叶,CHS(Unigene0008250)、CHI(Unigene0013781)和F3H的表达量都高于CHS(Unigene0012884)和C3′H。【结论】通过对转录组数据分析,共获得铁皮石斛黄酮类化合物代谢相关Unigenes 48个,涉及14个酶;5个CHS相关Unigenes中,2个编码查尔酮合酶,3个编码联苄合酶;CHI(Unigene0013781)属于类型I查尔酮异构酶。
关 键 词:铁皮石斛 转录组 黄酮 功能注释 表达 代谢
分 类 号:R28[中药学类]
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