期刊文章详细信息
飘鱼微卫星位点的筛选及珠江流域5个地理群体的遗传多样性分析
MICROSATELLITE PRIMERS SCREENING AND GENETIC DIVERSITY ANALYSIS OF FIVE GEOGRAPHICAL POPULATIONS OF PSEUDOLAUBUCA SINENSIS IN THE PEARL RIVER BASIN
文献类型:期刊文章
RUAN Hui-Ting;XU Shan-Nan;LI Min;DAI Jia-Ge;LI Zhen-Hai;ZOU Ke-Shu;LIU Li(College of Marine Science,South China Agricultural University,Guangzhou 510642,China;Key Laboratory of South China Sea Fishery Resources Exploitation&Utilization,Ministry of Agricultural and Rural Affairs,South China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou 510300,China;Key Laboratory of Open-Sea Fishery Development,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,South China Sea Fisheries Research Institute,Chinese Academy of Fishery Sciences,Guangzhou 510300,China)
机构地区:[1]华南农业大学海洋学院,广州510642 [2]中国水产科学研究院南海水产研究所,农业农村部南海渔业资源开发利用重点实验室,广州510300 [3]中国水产科学研究院南海水产研究所,农业农村部外海渔业开发重点实验室,广州510300
基 金:国家重点研发计划子课题(2018YFD0900802);农业部南海渔业资源开发利用重点实验室开放课题(FREU2015-09);中国-东盟海上合作基金(CAMC-2018F)资助。
年 份:2020
卷 号:44
期 号:3
起止页码:501-508
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、JST、PROQUEST、RCCSE、WOS、ZGKJHX、核心刊
摘 要:为了解珠江流域飘鱼(Pseudolaubuca sinensis)群体间的遗传多样性及其分化程度,利用RAD-Seq技术开发出微卫星位点,并设计了100对微卫星引物,筛选出66个可稳定扩增出目的条带的位点,其中16个具有较高的多态性(PIC>0.5),以2碱基重复居多。利用其中10对多态性位点对珠江流域的郁江(YuJ)、左江(ZJ)、右江(YJ)、融江(RJ)和桂江(GJ)飘鱼群体进行遗传多样性研究,得到有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度范围分别为5.2028-6.3800、0.6773-0.7667和0.7975-0.8425,表明珠江流域5个飘鱼群体具有较高的遗传多样性,以YuJ群体遗传多样性最高, RJ群体遗传多样性为最低。且群体间各个遗传参数相差较小,说明他们的遗传多样性水平相近。AMOVA分析显示,遗传变异主要来自于群体内(98.45%),仅一小部分的变异来自于群体间(1.55%),总群体的遗传分化系数Fst为0.015,两两群体间的Fst在–0.0033-0.0295波动,属于低等程度的分化。群体间基因交流值(Nm)在8.2246-76.0075,表明群体间基因交流频繁,对遗传漂变作用的抵制能力较强。研究筛选出了多态性高的微卫星位点,并利用其对5个飘鱼群体遗传多样性进行评价,旨在有效地监测飘鱼的种质资源状况,为其资源的开发利用和保护提供科学指导。
关 键 词:飘鱼 微卫星 遗传多样性 珠江流域 分化
分 类 号:Q346.5]
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