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宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌感染病原学诊断的价值
Etiological diagnostic value of metagenomic next-generation sequencing in non-tuberculous mycobacteria infection
文献类型:期刊文章
MIAO Qing;YAO Yu-meng;PAN Jue;BAO Rong;WANG Qing-qing;LI Na;CHEN Yan-qiong;JIN Wen-ting;ZHANG Yao;SU Yi;MA Yu-yan;HUANG Ying-nan;HU Bi-jie(Department of Infectious Diseases, Zhongshan Hospital, Fudan University, Shanghai 200032, China)
机构地区:[1]复旦大学附属中山医院感染病科,上海200032
基 金:国家自然科学基金(81902107)。
年 份:2020
卷 号:27
期 号:4
起止页码:559-562
语 种:中文
收录情况:JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:目的:探讨宏基因二代测序(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)技术对非结核分枝杆菌(non-tuberculosis mycobacteria,NTM)感染病原学诊断的价值。方法:回顾性选取2018年9月至2019年12月复旦大学附属中山医院感染病科收治的疑似NTM感染患者183例,共计样本388例,比较常规微生物培养法和mNGS技术对NTM病原体的检出率差异及不同样本类型的亚组分析。结果:常规微生物培养法和mNGS总体检测阳性率差异无统计学意义(21.9%vs 24.7%)。痰液样本培养法的阳性率明显高于mNGS(56.6%vs 22.9%,P<0.0001),而组织样本却低于mNGS(7.8%vs 27.8%,P<0.0001)。另外,mNGS对患者抗菌药物调整频率低于培养法(20.3%vs 40.2%,P<0.05)。结论:mNGS对NTM灵敏度较低,需重点改进以促进此技术更好地应用于临床。
关 键 词:非结核分枝杆菌 宏基因二代测序技术 常规微生物培养法
分 类 号:R563]
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