文献类型：期刊文章

作　　者：刘董剑[1] 梁亚冰[2] 崔宏伟[2] 张岩[3] 杨凌[2]

Liu Dongjian;Liang Yabing;Cui Hongwei(Inner Mongolia Medical University,Inner Mongolia 010110,China)

机构地区：[1]内蒙古医科大学,呼和浩特010110 [2]内蒙古医科大学附属医院临床医学研究中心、内蒙古自治区医学细胞生物学重点实验室,呼和浩特010050 [3]内蒙古医科大学基础医学院遗传学教研室,呼和浩特010110

出　　处：《医学研究杂志》

基　　金：国家自然科学基金资助项目(31960153);内蒙古自治区自然科学基金资助项目(2018MS08076);内蒙古自治区第七批草原英才工程项目(02036010)。

年　　份：2020

卷　　号：49

期　　号：9

起止页码：46-50

语　　种：中文

收录情况：JST、ZGKJHX、普通刊

摘　　要：目的探讨通过沉默Smoothened(Smo)基因抑制Hedgehog通路后,小鼠胚胎成纤维细胞NIH/3T3中mRNA表达谱的变化。方法提取Smo沉默和对照NIH/3T3细胞的总RNA,并进行测序。与对照组比较,分析差异表达的mRNA,通过BLAST2GO和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析和预测这些差异表达mRNA的相关功能。选取差异表达mRNA进行实时定量PCR验证。结果通过测序在Smo沉默的NIH/3T3细胞中发现有2289个mRNA差异表达,其中1646个mRNA在Smo沉默后表达下调,而643个mRNA表达上调。荧光实时定量PCR结果与测序结果一致。生物信息学分析显示,差异表达mRNA参与细胞过程、单有机体过程、生物学调节。差异表达mRNA富集在轴突导向(ko04360)、癌症通路(ko05200)、癌症中的microRNA(ko05206)等通路。利用GEPIA数据库分析CXCL12、IL-33、TGF-β2和FGF10及其受体在食管癌和正常食管组织中的表达情况,和预后的预测分析。结论在NIH/3T3细胞中沉默Smo抑制Hedgehog通路可能会通过细胞因子CXCL12、IL-33、TGF-β2和FGF10影响肿瘤细胞的增殖。

关 键 词：小鼠胚胎成纤维细胞  HEDGEHOG通路 SMOOTHENED mRNA表达谱分析  

分 类 号：R735.1]