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基于病理“金标准”标记脊髓损伤慢性期MRI图像坏死区域的方法
Study on the method of marking the necrotic area of MRI image in chronic spinal cord injury based on pathological “gold standard”
文献类型:期刊文章
BAO Xingxing;ZHAO Can;BAO Shusheng;RAO Jiasheng;YANG Zhaoyang;Li Xiaoguang(School of Biological Science and Medical Engineering,Beihang University/Beijing Key Laboratory of Biomaterials and Neural Regeneration,Beijing 100083,China;Institute of Rehabilitation Engineering,China Rehabilitation Science Institute,Beijing 100068,China;Beijing Advanced Innovation Center for Biomedical Engineering,Beihang University,Beijing 100083,China;Department of Neurobiology/School of Basic Medical Sciences,Capital Medical University,Beijing 100069,China)
机构地区:[1]北京航空航天大学生物与医学工程学院/生物材料与神经再生北京市重点实验室,北京100083 [2]中国康复科学所康复工程研究所,北京100068 [3]北京航空航天大学生物医学工程高精尖创新中心,北京100083 [4]首都医科大学基础医学院/神经生物学系,北京100069
基 金:国家自然科学基金(31900980,31970970,31730030,31650001,31670988,31320103903,31771053);北京市自然科学基金(7194286,KZ201810025030);国家重点研发计划(2017YFC1104001,2017YFC1104002);中国博士后科学基金面上资助项目(2018M640046);北京市科技计划(Z181100001818007);中央高校基本科研业务费专项资金资助(YWF-20-BJ-J-811)。
年 份:2020
卷 号:37
期 号:11
起止页码:1373-1379
语 种:中文
收录情况:CSCD、CSCD_E2019_2020、JST、ZGKJHX、普通刊
摘 要:脊髓损伤慢性期胶质瘢痕及其所包绕的囊腔所构成的脊髓坏死区域在磁共振成像(MRI)中形态各异,边界模糊。针对单纯根据图像无法准确识别脊髓坏死区域这一问题,提出一种基于病理切片"金标准"来标记MRI图像实际坏死区域的方法。双边滤波去噪并刚体配准脊髓损伤慢性期的多模态MRI图像,使用Snake模型进行脊髓的分离,并利用双三次插值法对脊髓进行拉直。采用双树复小波变换融合不同模态的图像后,基于病理切片的胶质瘢痕及囊腔区域与MRI图像的脊髓坏死区域具有空间相对位置一致性的特点,建立从脊髓病理切片到MRI图像的空间映射关系,最终实现MRI图像中实际坏死区域的标记。以圆度和偏心率作为形状评价指标,对本方法标记的MRI坏死区域与病理切片"金标准"结果进行对比,相似度分别达到了0.93±0.03和0.97±0.02。结果表明,应用本方法构建的映射关系能较为准确、客观地标记MRI图像的实际坏死区域,为后期计算机自动识别与分割MRI坏死区域奠定基础。
关 键 词:脊髓损伤慢性期 磁共振成像 病理切片 坏死区域 标记
分 类 号:R318[生物医学工程类]
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