文献类型：期刊文章

作　　者：周强[1] 孙冬伟[2] 李海燕[3] 岳杰[4] 陈旭辉[5] 曲波[5] 张丽杰[6]

ZHOU Qiang;SUN Dong-wei;LI Hai-yan;YUE Jie;CHEN Xu-hui;QU Bo;ZHANG Li-jie(Forestry Development Service Center of Liaoning Province,Shenyang 110031,China;Fushun Forestry Development Service Center,Fushun Liaoning 113006,China;Fushun Management Station of Liaoning Laotudingzi National Nature Reserve,Fushun Liaoning 113208,China;Shenyang Dongling Park Management Center,Shenyang 110161,China;College of Bioscience and Biotechnology,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110161,China;College of Forestry/Key Laboratory of Forest Tree Genetics,Breeding and Cultivation of Liaoning Province,Shenyang Agricultural University,Shenyang 110161,China)

机构地区：[1]辽宁省林业发展服务中心,沈阳110031 [2]抚顺市林业发展服务中心,辽宁抚顺113006 [3]辽宁老秃顶子国家级自然保护区抚顺管理站,辽宁抚顺113208 [4]沈阳市东陵公园管理中心,沈阳110161 [5]沈阳农业大学生物技术学院,沈阳110161 [6]沈阳农业大学林学院/辽宁省林木遗传育种与培育重点实验室,沈阳110161

出　　处：《沈阳农业大学学报》

基　　金：国家林业局濒危物种保护和挽救项目(2013028)。

年　　份：2020

卷　　号：51

期　　号：6

起止页码：721-726

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSCD、CSCD2019_2020、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：双蕊兰(Diplandrorchis sinica)为兰科单种属孓遗植物,其罕见的原始类型在兰科植物系统进化和发育研究上具有重要意义。为从分子水平探讨根际土壤细菌对双蕊兰濒危机制的影响,通过选取双蕊兰肉质根0~4mm的根际土,基于Illumina Miseq测序平台对濒危物种双蕊兰根际土壤细菌16S rRNA基因的V3~V4高变区片段进行高通量测序。结果表明:测序共获得26690条16S r RNA原始序列,深度测序获得为26471条有效基因序列。基于≥97%的相似度水平,对有效序列利用QIIME软件处理操作分类单元,聚类分析后共获得9556个OTUs。Illumina Miseq高通量测序显示,双蕊兰根际土壤细菌呈多样性分布,且在门、纲、目、科、属分类水平上的优势类群较为突出,主要涵盖了变形菌门(Proteobacteria),放线菌门(Actinobacteria),拟杆菌门(Bacteroiteria),酸杆菌门(Acidobacteria),疣微菌门(Verrucomicrobia)。其中,变形菌门和放线菌门为优势菌群,两者相对丰度之和达到61.80%。双蕊兰根际土壤细菌多样性在门、纲、目、科、属分类水平上的优势细菌类群主要为变形菌门(Protecbacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、根瘤菌目(Rhizobiales)、生丝微菌科(Hyphomicrobiaceae)和未被确定分类的盖氏菌属(Unclassified Gaiellaceae)。

关 键 词：双蕊兰  根际细菌 高通量测序

分 类 号：Q938.1]