文献类型：期刊文章

作　　者：张孝璐[1] 杨兰[1] 孙岩松[1] 徐东平[2] 李晓峰[1] 刘妍[2] 李浩[1]

Zhang Xiao-Lu;Yang Lan;Sun Yan-Song;Xu Dong-Ping;Li Xiao-Feng;Liu Yan;Li Hao(State Key Laboratory of Pathogenic Microorganism Biosafety,Institute of Microbiology and Epidemiology,Academy of Military Medicine,Academy of Military Sciences,Beijing 100071,China;Department of Infectious Diseases,the Fifth Medical Center of Chinese PLA General Hospital,Beijing 100039,China)

机构地区：[1]病原微生物生物安全国家重点实验室,军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所,北京100071 [2]解放军总医院第五医学中心感染病医学部,北京100039

出　　处：《解放军医学杂志》

基　　金：国家自然科学基金(81573676);北京市自然科学基金(7194302)。

年　　份：2021

卷　　号：46

期　　号：5

起止页码：448-455

语　　种：中文

收录情况：AJ、BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、DOAJ、EMBASE、IC、JST、PROQUEST、RCCSE、SCOPUS、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：目的分析恩替卡韦耐药乙型肝炎病毒(ETV-r HBV)稳定转染前后宿主细胞转录组水平的基因差异表达,为后续开展HBV感染相关机制研究提供基础数据和参考。方法对ETV-r HBV稳定转染细胞株(HepG2.A64)及其原始背景细胞株(HepG2)进行转录组测序(n=3),利用DESeq2软件以|log2 Fold Change|>2、padj<0.05为差异基因筛选条件对测序结果进行差异基因筛选;利用clusterProfiler软件对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG功能富集分析。采用RT-qPCR及Western blotting分别检测HBV稳定转染前后宿主细胞DNA修复相关基因mRNA及蛋白的表达水平。结果转录组测序结果显示,与HepG2细胞系相比,ETV-r HBV稳定转染的HepG2.A64细胞系共有613个基因存在差异表达,其中401个上调,212个下调(padj<0.05),GO和KEGG富集分析结果显示,差异表达基因主要参与炎症反应、PI3K/Akt信号通路、PPAR信号通路、NF-κB信号通路以及免疫相关的生物学过程。RT-qPCR及Western blotting检测结果显示,与HepG2细胞系相比,HepG2.A64细胞系中RAD52和XRCC2 mRNA表达量分别下降68.96%±7.59%、69.58%±6.32%,RAD52和XRCC2蛋白表达量分别下降69.93%±3.88%、26.47%±12.7%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论与原始细胞系HepG2相比,ETV-r HBV稳定转染的HepG2.A64细胞系在转录水平出现大量差异表达基因,同时HepG2.A64细胞系中DNA修复相关基因表达量出现下调。

关 键 词：乙型肝炎病毒 DNA修复 计算生物学 转录组测序  恩替卡韦 HepG2.A64细胞系  

分 类 号：R373]