期刊文章详细信息
基于SSR标记的芥菜品种鉴定技术体系建立及应用
Establishment and Application of Mustard Variety Identification System Based on SSR Markers(Brassica juncea L.)
文献类型:期刊文章
YAN Xin-lin;GUAN Zhong-rong;WEN Wen;ZHANG Zhe-feng;WANG Chen-yu;SHEN Jin-juan;WANG Qi-ming;HAN Rui-xi;RAO Li-qun(College of Bioscience and Biotechnology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128;Development Center of Science and Technology,Ministry of Agriculture and Rural Affairs,Beijing 100122;Chongqing Yudongnan Academy of Agricultural Science,Chongqing 400712;Institute of Crop Science,Sichuan Academy of Agricultural Sciences,Chengdu 610000)
机构地区:[1]湖南农业大学生物科学技术学院,长沙410128 [2]农业农村部科技发展中心,北京100122 [3]重庆市渝东南农业科学院,重庆400712 [4]四川省农业科学院作物研究所,成都610000
基 金:湖南省发改委科技专项课题(湘发改投资[2014]658号)。
年 份:2021
卷 号:22
期 号:3
起止页码:758-770
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、CAS、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:利用SSR分子标记建立芥菜品种鉴定体系,旨在为我国芥菜育成品种鉴定提供高通量、快速鉴定方法。选取芥菜16个变种代表性品种用于SSR引物初筛,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从432对引物中筛选出84对条带清晰、稳定性好、多态性高的芥菜SSR引物,并对筛选出的引物5′端进行荧光标记。另外选取96份品种对上述84对引物进行复筛,利用基因分析仪对所有扩增片段大小进行分析,依据各引物的扩增稳定性、峰型易读取程度、多态性及染色体位置等,最终筛选出25对SSR引物作为核心引物,并为其设置参照品种以消除不同试验批次或平台等因素引起的误差。根据荧光颜色和扩增片段大小将25对核心引物分成6组,建立基于SSR标记的芥菜品种鉴定体系。利用该套核心引物构建了189份芥菜品种的DNA指纹数据库,共检测到175个等位变异,平均每对引物检测到7个等位变异;基因多样性指数变化为0.239~0.870,平均为0.555;多态性信息含量在0.23~0.86之间,平均为0.493。本研究建立的基于毛细管电泳平台的芥菜SSR分子标记品种鉴定体系,可用于芥菜品种真实性快速鉴定、遗传多样性分析和DUS测试近似品种辅助筛选等。
关 键 词:芥菜 SSR标记 品种鉴定 DNA指纹图谱
分 类 号:S637]
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