文献类型：期刊文章

作　　者：方亦圆[1] 严维[1] 吴建新[1] 殷冬梅[2] 唐晓艳[1,3]

FANG Yiyuan;YAN Wei;WU Jianxin;YIN Dongmei;TANG Xiaoyan(Guangdong Provincial Key Laboratory of Biotechnology for Plant Development,School of Life Sciences,South China Normal University,Guangzhou 510631,China;College of Agronomy,Henan Agricultural University,Zhengzhou 450002,China;Shenzhen Institute of Molecular Crop Design,Shenzhen 518107,Guangdong,China)

机构地区：[1]华南师范大学生命科学学院,广东省植物发育生物工程重点实验室,广州510631 [2]河南农业大学农学院,郑州450002 [3]深圳市作物分子设计育种研究院,广东深圳518107

出　　处：《生物信息学》

基　　金：国家自然科学基金联合基金项目(No.U1704232)。

年　　份：2021

卷　　号：19

期　　号：2

起止页码：115-127

语　　种：中文

收录情况：ZGKJHX、普通刊

摘　　要：MYB转录因子是植物中重要的基因家族之一,参与多种生物学功能的调控。目前对花生(Arachis hypogaea)MYB转录因子家族的功能仍知之甚少,对花生中MYB转录因子的鉴定及生物信息学分析具有重要的意义。本研究在栽培花生中共鉴定出MYB转录因子443个,包括219个1R-MYB、209个2R-MYB、12个3R-MYB以及3个4R-MYB,它们不均匀地分布在20条染色体上,大多集中于染色体末端;MYB结构域分析表明,R2结构包含3个极度保守的色氨酸残基,R1第三个保守色氨酸、R3结构域第一个保守色氨酸分别被其它疏水氨基酸替代;系统发育树显示,大多数聚类在相近分支中的MYB转录因子在对应染色体上的分布位置相近。鉴定到的AhMYB部分同源基因对共有170对,其中有72对在至少一个组织中表现出表达偏向性;功能富集分析显示,偏向性基因对、非偏向性基因对、无配对基因对在功能上有一定的差异。栽培花生基因组中的AhMYB基因在转录水平上表达模式各异,但其蛋白具有一定的进化保守性和结构多样性,显示出在花生演化过程中,MYB家族成员存在大量的功能异化。本研究为后续探究AhMYB基因功能奠定了基础。

关 键 词：栽培花生  MYB转录因子 基因家族 生物信息学 部分同源表达偏向  

分 类 号：Q37]