期刊文章详细信息
甲基化数量性状定位分析microRNA-122 rs1135519多态性与肿瘤遗传易感性
Methylation quantitative trait loci analysis of microRNA-122 rs1135519 polymorphism and tumor genetic susceptibility
文献类型:期刊文章
Wang Yukun;Yang Haili;Li Hongyong;Jiang Min;Su Liang;Chen Yingni;Xiang Mengyan;Yu Xiangyuan(Scientific Experimental Center of Guilin Medical University,Guilin 541199,China;Institute of Preventive Medicine of School of Public Health of Guilin Medical University,Guilin 541199,China)
机构地区:[1]桂林医学院科学实验中心,桂林541199 [2]桂林医学院公共卫生学院预防医学研究所,桂林541199
基 金:广西自然科学基金面上项目(2020GXNSFAA238025);国家自然科学基金地区基金项目(81660567)。
年 份:2022
卷 号:45
期 号:1
起止页码:1-6
语 种:中文
收录情况:CAS、普通刊
摘 要:目的基于公共数据库中microRNA-122(miR-122)DNA甲基化和基因多态性分型数据,探讨rs1135519 T>C多态性与肿瘤遗传易感性的关系。方法利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)和泛癌种甲基化数量性状位点(Pan-cancer methylation quantitative trait loci,Pancan-meQTL)数据库,关联分析rs1135519基因型与其上下游1 Mb区域内CpG位点的甲基化修饰水平的相关性。结果线性回归分析结果发现,rs1135519 T>C与子宫体子宫内膜癌(uterine corpus endometrial carcinoma,UCEC)、膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BLCA)、结直肠癌(colorectal cancer,CRC)、胃腺癌(stomach adenocarcinoma,STAD)等9种肿瘤患者组织中miR-122基因启动子区cg19165390、cg12907477或cg19312305 CpG位点的甲基化状态显著相关,差异具有统计学意义(P<0.001)。结论rs1135519 T>C可能作为meQTL位点,通过影响miR-122启动子区DNA甲基化修饰状态调控肿瘤的发生发展。
关 键 词:microRNA-122 rs1135519 DNA甲基化 甲基化数量性状位点
分 类 号:R730.2]
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