期刊文章详细信息
利用生物信息学方法分析IscA1基因在肝细胞癌中的表达意义
The Expression of IscA1 Gene in Hepatocellular Carcinoma Analyzed by Bioinformatics
文献类型:期刊文章
GAO Ying;HUA Zi-chun(School of Life Sciences,Nanjing University,Nanjing 210023,China;School of Biopharmaceuticals,China Pharmaceutical University,Nanjing 211198,China;Changzhou High-Tech Research Institute of Nanjing University and Institute of Pharmaceutical Biotechnology of Jiangsu Industrial Technology Research Institute,Changzhou 213164,China)
机构地区:[1]南京大学生命科学学院,江苏南京210023 [2]中国药科大学生物药物学院,江苏南京211198 [3]常州南京大学高新技术研究院暨江苏省产业技术研究院医药生物技术研究所,江苏常州213164
基 金:常州市科技局项目(No.CZ20210010,No.CJ20210024)。
年 份:2022
卷 号:29
期 号:5
起止页码:448-453
语 种:中文
收录情况:CAS、EMBASE、IC、SCOPUS、ZGKJHX、普通刊
摘 要:通过研究IscA1在肝癌中的表达、临床数据、功能分析以及与肿瘤免疫关系,探讨IscA1在肝癌中的重要作用。使用TIMER2数据库分析IscA1在肝癌组织和正常组织中的表达差异以及与肿瘤免疫浸润的关系,使用GEPIA2数据库分析IscA1对肝癌患者总生存期和无病生存期的影响,分析IscA1与临床分期的关系,使用LinkedOmics数据库进行功能富集分析,使用TISIDB数据库分析IscA1与肿瘤免疫分子的关系。结果显示IscA1在肝癌以及胆管癌、头颈部鳞状细胞癌等显著高表达,在乳腺浸润癌、结肠癌、多形成性胶质细胞瘤、肾嫌色细胞癌等显著低表达。IscA1随着肿瘤分期表达水平显著升高。IscA1高表达降低总生存期和无病生存期,可能与不良预后相关。通过功能富集分析,提示IscA1可能通过脂肪酸降解、精氨酸生物合成、苯丙氨酸代谢、TCA循环参与肝癌的进展。IscA1的分子功能主要涉及到基因表达、核糖体、酶活性等。IscA1表达水平与肿瘤免疫细胞浸润水平密切相关,尤其与中性粒细胞相关性最强。IscA1与多种免疫抑制因子、免疫刺激因子以及MHC分子存在相关性。IscA1在肝癌中高表达,与患者不良预后相关,其参与肝癌进程的调控方式可能是脂肪酸代谢和肿瘤免疫。
关 键 词:IscA1 肝癌 生物信息学 预后价值 表达差异 脂肪酸代谢 肿瘤免疫
分 类 号:Q81[生物工程类]
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