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期刊文章详细信息

表皮葡萄球菌SE1457与vraSR突变株转录组测序比较分析    

Comparison analysis on the transcriptome sequencing of Staphylococcus epidermidis SE1457 and its isogenic vraSR mutant strain

  

文献类型:期刊文章

作  者:孙士正[1] 孟媛媛[1] 张维娜[1] 刁德睿[1] 陈晓婷[1] 武有聪[1]

SUN Shi-zheng;MENG Yuan-yuan;ZHANG Wei-na;DIAO De-rui;CEHNG Xiao-ting;WU You-cong(Integrated Lab of Pathogenic Biology,School of Basic Medical Sciences,Dali University,Dali,Yunnan 671000,China)

机构地区:[1]大理大学基础医学院病原生物学综合实验室,云南大理671000

出  处:《中国病原生物学杂志》

基  金:国家自然科学基金项目(No.82060380,81660346);复旦大学教育部/卫健委医学分子病毒学重点实验室开放课题(No.FDMV-2021002)。

年  份:2022

卷  号:17

期  号:11

起止页码:1241-1246

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2020、CAB、CSCD、CSCD2021_2022、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊

摘  要:目的筛选和验证VraSR调控的下游靶基因,为表皮葡萄球菌vraSR生物学功能研究提供参考。方法在加与未加万古霉素(Van+/Van-)两种条件下,抽提表皮葡萄球菌SE1457及其同源性vraSR突变株RNA,构建cDNA文库(每个菌株3个独立样品),采用Illumina HiSeq进行转录组测序,差异表达基因筛选标准为Q value<0.05,且表达值变化倍数FC≥2(FDR校正P<0.05,t检验),对差异表达基因进行GO及KEGG分析,并进行qRT-PCR验证。结果与SE1457野生株相比,Van+条件下vraSR突变株有39个差异表达基因(16个下调,23个上调),Van-条件下vraSR突变株有61个差异表达基因(35个下调,26个上调),差异表达基因主要涉及糖代谢、磷酸戊糖途径、三羧酸循环等。Van+/Van-2种条件下qRT-PCR检测生物膜形成相关基因icaA相对表达量分别为0.44±0.06和0.17±0.05(P<0.01),icaR为4.35±0.79(P<0.01)和9.27±4.4(P<0.05),未发现耐药相关基因(pbp2,sgtB,murZ)转录水平改变(P>0.05)。结论表皮葡萄球菌VraSR可能通过ica途径调控生物膜形成,并通过调节肽聚糖合成相关基因的转录间接影响耐药性。

关 键 词:万古霉素耐药相关双组分系统  转录组测序分析  表皮葡萄球菌

分 类 号:R378]

参考文献:

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同被引文献:

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