文献类型：期刊文章

作　　者：胡亚平[1] 郭雁君[1] 吉前华[1] 蒋惠[1] 杨凤梅[1] 郭丽英[1]

HU Yaping;GUO Yanjun;JI Qianhua;JIANG Hui;YANG Fengmei;GUO Liying

机构地区：[1]肇庆学院果树研究所/肇庆学院生命科学学院,广东肇庆526061

出　　处：《中国南方果树》

年　　份：2022

卷　　号：51

期　　号：6

起止页码：16-21

语　　种：中文

收录情况：BDHX、BDHX2020、CAB、ZGKJHX、核心刊

摘　　要：植物的几丁质酶与其抗病能力、防御反应和生长发育密切相关。通过检索华中农业大学公布的柑桔基因组数据网站,发现了32个几丁质酶基因,使用生物信息学软件对这些基因进行分子量、等电点、信号肽、细胞定位、转录谱、保守结构域、系统发育树等方面进行研究。结果表明,该家族基因中有26个成员在染色体上的定位明确,其余6个的位置尚未确定。这些几丁质酶基因家族成员的蛋白分子量、氨基酸残基和等电点分别在14.8~72.7 kDa、134~636个和4.53~9.21之间。除3个预测蛋白不含信号肽外,其余29个均含有信号肽;在有信号肽的蛋白中,23个蛋白定位在细胞外,6个横跨细胞膜。这些基因在花、叶、果实和愈伤等组织中转录水平相差巨大,有的在几种组织中转录水平都很高,有的在不同组织中转录水平相差很大,有的在所有组织中表达量都很低。用最大似然法对蛋白序列构建系统发育树,结合保守结构域的分析结果,可将这些几丁质酶基因分为4类。第1类的5个编码蛋白都有信号肽且定位在细胞外,含GH18几丁质酶结构域,且有糖基水解酶的功能;第2类的10个编码蛋白都是有信号肽的跨膜蛋白,也有GH18几丁质酶结构域,还有一个丝氨酸/苏氨酸激酶的结构域;第3类的16个编码蛋白都有信号肽且定位在细胞外,有GH19几丁质酶结构域,同时具有溶菌酶的活性;第4类,仅有1个基因(orange1.1t00476.1),编码的是无信号肽的跨膜蛋白,有GH18几丁质酶结构域,同时具有糖基水解酶的功能,此外还含有抗病蛋白中常见的PPR重复结构域。

关 键 词：柑桔 几丁质酶 基因家族

分 类 号：S666]