期刊文章详细信息
建兰MYB基因家族鉴定及在盐胁迫下的表达分析
Identification of MYB gene family in Cymbidium ensifolium and its expression analysis under salt stress
文献类型:期刊文章
Deng Wenkai
机构地区:[1]贵州民族大学生态环境工程学院,贵州贵阳550025 [2]贵州民族大学研究生工作部,贵州贵阳550025 [3]贵州民族大学工程实训中心,贵州贵阳550025
基 金:贵州省特色林业产业项目(编号:特林研2020-04);贵州省大学生创新创业项目(编号:S202010672021)。
年 份:2023
卷 号:51
期 号:21
起止页码:19-28
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2020、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:植物MYB家族是最大的转录因子家族,在植物胁迫反应中起着重要作用。基于全基因组分析,对建兰(Cymbidium ensifolium)MYB家族成员进行鉴定和生物信息学分析,并分析相关基因在不同盐胁迫类型下的表达情况。结果表明,从建兰基因组中共鉴定出136个CeMYB转录因子,包括27个1R-MYB、102个R2R3-MYB、5个3R-MYB和2个4R-MYB。通过与拟南芥MYB进行系统发育得到20个基因簇,表明这些CeMYB可能具有多种生物学功能。亚细胞定位、染色体定位及保守域显示,136个CeMYB分布在18条染色体上,大多数CeMYB位于细胞核中,且具有典型的氨基酸序列重复;基序预测分析表明,多个保守元件主要位于CeMYB的N端,表明它们的功能相对保守。转录组表达分析表明,S13亚家族的CeMYB61和CeMYB89可能是调控盐胁迫的关键基因,qRT-PCR验证进一步表明,CeMYB61、CeMYB89在不同组织中表现为根系>假鳞茎>叶片>花序,其表达水平、模式与植株Na+浓度分布一致,证实CeMYB61、CeMYB89是建兰耐受盐胁迫的指示基因。研究为进一步探索MYB基因的潜在机制及盐胁迫下候选基因的挖掘提供了理论基础。
关 键 词:建兰 MYB转录因子 盐胁迫 基因组 QRT-PCR
分 类 号:S682.310.1]
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