期刊文章详细信息
系统性红斑狼疮和COVID-19共有的诊断标志物
The shared biomarkers and pathways of systemic lupus erythematosus and novel coronavirus pneumonia
文献类型:期刊文章
GENG Huae;LIU Jingyuan;DONG Yao;ZHANG Pengfei;QIU Yujie;ZHENG Jiaxin;LIU Wenying;XU Sen;YUE Zhen(Department of pharmacy,Binzhou Hospital of TCM,Binzhou 251700,Shandong,P.R.China;Second School of Clinical Medicine,Binzhou Medical University,Yantai 264003,Shandong,P.R.China;School of Stomatology,Binzhou Medical University,Yantai 264003,Shandong,P.R.China;School of Public Health,Binzhou Medical University,Yantai 264003,Shandong,P.R.China;School of Pharmacy,Binzhou Medical University,Yantai 264003,Shandong,P.R.China;Department of Biochemistry and Molecular Biology,School of Basic Medical Sciences,Binzhou Medical University,Yantai 264003,Shandong,P.R.China)
机构地区:[1]滨州市中医医院药学部,山东滨州251700 [2]滨州医学院第二临床医学院,山东烟台264003 [3]滨州医学院口腔医学院,山东烟台264003 [4]滨州医学院公共卫生学院,山东烟台264003 [5]滨州医学院药学院,山东烟台264003 [6]滨州医学院基础医学院生物化学与分子生物学教研室,山东烟台264003
基 金:滨州市中医医院中医药专项项目(2023ZYZX012);滨州医学院新型冠状病毒感染防控研究培育项目(50012305193)。
年 份:2025
卷 号:48
期 号:3
起止页码:327-333
语 种:中文
收录情况:普通刊
摘 要:目的由于自身免疫耐受的打破,系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)患者可能在感染COVID-19后存在更高的重症率和死亡率,本研究拟通过多种分析方法分析两种疾病的关联及共同易感基因及通路。方法进行差异表达基因分析,加权基因共表达网络分析,GO-KEGG分析,构建蛋白-蛋白相互作用网络。利用支持向量机和LASSO算法筛选共享枢纽基因,使用CIBERSORT估计共享枢纽基因及免疫浸润之间的相关性。使用单细胞RNA测序数据验证重要的枢纽基因。结果共同基因富集到免疫应答调控过程,其中最高的前3个显著基因是OASL、OAS1以及IFI6。发现了CD1C、KLRB1以及CXCR6三个共同的诊断标志物。筛选出10个小分子化合物,有望为临床治疗提供参考。结论本研究确定了SLE和COVID-19的共享枢纽基因,确定了其作为共同的诊断依据及治疗靶点的可能性,为SLE合并COVID-19的发病机制和联合治疗提供了新的见解。
关 键 词:系统性红斑狼疮 COVID-19 生物信息学 机器学习 单细胞分析
分 类 号:R593.2]
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