期刊文章详细信息
基于比较转录组的紫红獐牙菜组织差异表达分析
Analysis of Differential Expression in the Tissues of Swertia punicea Based on Comparative Transcriptomics
文献类型:期刊文章
Zhang Ting;Wang Miaomiao;Zhou Xuhong;Liu Xiaoli(College of Traditional Chinese Medicine,Yunnan University of Traditional Chinese Medicine,Kunming,650500;Yunnan Provincial Key Laboratory of Molecular Biology for Sino Medicine,Yunnan University of Chinese Medicine,Kunming,650500;Scientific Research and Experiment Center of Yunnan University of Traditional Chinese Medicine,Kunming,650500)
机构地区:[1]云南中医药大学中药学院,昆明650500 [2]云南中医药大学,云南省中医药分子生物学重点实验室,昆明650500 [3]云南中医药大学科研实验中心,昆明650500
基 金:国家自然科学基金项目(81660634);云南省高校药用食用花卉科技创新团队(2020YGC01);云南省中医药大学分子生物学重点实验室(30270105850)共同资助。
年 份:2025
卷 号:23
期 号:14
起止页码:4637-4644
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2023、核心刊
摘 要:为挖掘紫红獐牙菜的次生代谢产物合成的调节基因以及分析其功能,本研究采用高通量测序技术对紫红獐牙菜根、茎、叶、花、果组织进行转录组测序,从差异表达的基因中鉴定与次生代谢产物合成有关的关键酶基因。结果显示,在根vs茎中有4013个显著差异表达的基因,根vs花中有5467个差异表达基因,根vs叶中有5899个差异表达基因,在根vs果中有5590个差异表达基因,将不同部位差异表达的基因进行KEGG富集分析,结果显示,不同部位中类黄酮生物合成的基因表达具有显著富集。在紫红獐牙菜差异表达基因集中搜索环烯醚萜类生物合成途径的关键酶,共有24条环烯醚萜类生物合成相关的unigene。本研究可为后续挖掘紫红獐牙菜次生物质代谢合成途径相关基因研究奠定基础,同时为后续紫红獐牙菜次生代谢物的生物合成调控研究提供理论依据。
关 键 词:紫红獐牙菜 差异表达 獐牙菜苦苷 转录组
分 类 号:S567.9]
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