登录    注册    忘记密码

期刊文章详细信息

山东图兰扇头蜱线粒体基因组全序列测定与分析    

Sequencing and analysis of the complete mitochondrial genome of Rhipicephalus turanicus in Shandong Province

  

文献类型:期刊文章

作  者:于莲琪[1,2] 苏杭丽[1,2] 王爽[3] 王志涛[4] 卜灿灿[1] 吕文祥[1] 王新梅[1,2] 刘丽娟[1,2] 盛兆安[3] 张本光[1,2]

YU Lianqi;SU Hangli;WANG Shuang;WANG Zhitao;BU Cancan;LV Wenxiang;WANG Xinmei;LIU Lijuan;SHENG Zhaoan;ZHANG Benguang(Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences,Shandong Institute of Parasitic Diseases,Jining 272033,Shandong,China;School of Public Health,Shandong First Medical University and Shandong Academy of Medical Sciences,Jinan 250117,Shandong,China;Department of Pathogenic Biology,School of Basic Medical Sciences,Jining Medical College,Jining 272067,Shandong,China;School of Biomedical Sciences(Provincial Pharmaceutical Biotechnology Research Centre),Shandong First Medical University(Shandong Provincial Academy of Medical Sciences),Jinan 250117,Shandong,China)

机构地区:[1]山东第一医科大学(山东省医学科学院),山东省寄生虫病防治研究所,山东济宁272033 [2]山东第一医科大学(山东省医学科学院)公共卫生与健康管理学院,山东济南250117 [3]济宁医学院基础医学院病原生物学教研室,山东济宁272067 [4]山东第一医科大学(山东省医学科学院)生物医学科学学院(省医药生物技术研究中心),山东济南250117

出  处:《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》

基  金:国家自然科学基金(81902096);济宁医学院贺林院士新医学临床转化工作站科研基金(JYHL2021MS22)。

年  份:2025

卷  号:43

期  号:3

起止页码:377-384

语  种:中文

收录情况:BDHX、BDHX2023、核心刊

摘  要:目的解析图兰扇头蜱(Rhipicephalus turanicus)线粒体全基因组的结构特征与系统发育关系,揭示不同地理种群之间的遗传分化,为进一步开展物种鉴定和系统发育分析等研究提供数据支撑。方法2023年8月,于山东省济宁市微山县马坡镇的一只家犬体表采集并鉴定图兰扇头蜱雄蜱1只,提取基因组DNA,采用Illumina测序平台二代测序技术进行测序,并利用Novoplasty软件进行序列组装,拼接完整的线粒体基因组全序列,使用MITOS软件对线粒体基因组进行初步功能注释。基于13个蛋白质编码基因(protein⁃coding gene,PCG)序列,应用最大似然法构建系统进化树。结果测序结果显示,图兰扇头蜱线粒体基因组全长为14718 bp(GenBank登录号:PV416795),由13个PCG、22个转运RNA基因、2个核糖体RNA和2个非编码区(NCR)组成。线粒体基因组基因之间存在重叠或基因间隔区,碱基组成呈现明显A+T偏向性。PCG以ATA、ATC、ATG和ATT等4种典型的ATN序列作为起始密码子,TAA、TAG、TA、T为终止密码子。在22个tRNA基因二级结构中,除trnC、trnF、trnS1缺少二氢尿嘧啶臂(DHU臂)和二氢尿嘧啶环(DHU环)导致不能形成完整的三叶草结构外,其余均能形成典型的三叶草结构。系统进化分析表明,本研究采集的山东图兰扇头蜱与北京种群(登录号:OM368330)、新疆种群(登录号:KY996841、NC035946、OM368326)共同聚为一支,并与来自以色列(登录号:OQ184023)和沙特阿拉伯(登录号:PP919886)的种群共同构成一个强支持的单系分支。不同地理种群图兰扇头蜱聚为同一高度支持的系统发育分支,表明其具有较强的遗传保守性,同时也显示出一定的地域性遗传分化趋势。结论本研究获得了山东图兰扇头蜱线粒体基因组全序列,符合硬蜱科线粒体基因组特征,不同地理种群间存在潜在的遗传分化趋势。

关 键 词:图兰扇头蜱  线粒体基因组 系统进化分析

分 类 号:R384.41]

参考文献:

正在载入数据...

二级参考文献:

正在载入数据...

耦合文献:

正在载入数据...

引证文献:

正在载入数据...

二级引证文献:

正在载入数据...

同被引文献:

正在载入数据...

版权所有©重庆科技学院 重庆维普资讯有限公司 渝B2-20050021-7
 渝公网安备 50019002500408号 违法和不良信息举报中心