期刊文章详细信息
缺氧诱导GLC-82、A549肺癌细胞的microRNAs差异表达谱分析
Hypoxia-induced differential expression profiles of microRNAs between GLC-82 and A549 lung cancer cells
文献类型:期刊文章
Wang Ying;Tang Chunming;Li Jinglin;Qiu Lijuan;Sun Qiangming(Teaching and Research Section of Pathology,Basic Teaching Department,Haiyuan College,Kunming Medical University;Department of Oncology,The First People’s Hospital of Yunnan Province;Emergency Department,The First Affiliated Hospital of Kunming Medical University;Institute of Pediatric Diseases,Kunming Children’s Hospital;Molecular Epidemiology Joint Laboratory,Chinese Academy of Medical Sciences&Peking Union Medical College)
机构地区:[1].昆明医科大学海源学院基础教学部病理教研室,昆明650106 [2]云南省第一人民医院肿瘤内科,昆明650101 [3]昆明医科大学第一附属医院急诊医学科,昆明650000 [4]昆明市儿童医院儿科疾病研究所,昆明650101 [5]中国医学科学院医学生物学研究所分子流行病联合实验室,昆明650118
基 金:云南省教育厅科研资助项目(编号:2015Y530)
年 份:2019
卷 号:44
期 号:7
起止页码:891-897
语 种:中文
收录情况:BDHX、BDHX2017、CAB、CAS、CSA、CSA-PROQEUST、CSCD、CSCD_E2019_2020、IC、JST、RCCSE、ZGKJHX、核心刊
摘 要:目的:对比缺氧环境下不同肺腺癌细胞株表达差异的microRNA,为进一步研究缺氧环境中肺癌细胞microRNA的作用机制提供参考。方法:建立缺氧模型,将培养于缺氧情况中及正常氧浓度下的GLC-82、A549细胞分别提取RNA,通过芯片检测及PCR验证,筛选差异表达的microRNA。利用TargetScanHuman 7.2数据库和cytoscape软件预测差异显著的microRNA分子调控的靶基因及可能参与的信号通路。结果:在缺氧条件下,A549细胞中3个microRNA表达上调,30个microRNA表达下调;而在GLC-82细胞中,2个microRNA表达上调,31个microRNA表达下调。两种细胞相比较,除miR-192-5p变化趋势相反外,其他microRNAs的表达变化趋势相同。通过KOBAS在线网站KEGG及GO预测分析,差异表达microRNA主要参与了肿瘤相关信号通路、胰岛素信号通路、Ras信号通路以及氧代谢等生物学过程。结论:肺癌细胞株在缺氧环境下和正常氧状态下mircoRNA出现表达差异,并且来源于不同遗传背景的细胞株之间也存在差异。差异表达的microRNA靶基因参与了多种细胞代谢相关通路,具有氧代谢,氧应答相关功能。
关 键 词:肺癌 肿瘤微环境 缺氧 微小核糖核酸
分 类 号:R734.2]
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