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会议论文详细信息

基于RNA-seq的阳春砂果实可溶性糖及萜类代谢的基因表达谱分析       

文献类型:会议

作  者:于安民 杨锦芬

作者单位:广州中医药大学中药资源科学与工程研究中心 岭南中药资源教育部重点实验室(广州中医药大学)

会议文献:生态文明建设中的植物学:现在与未来——中国植物学会第十五届会员代表大会暨八十周年学术年会论文集——第4分会场:资源植物学

会议名称:生态文明建设中的植物学:现在与未来——中国植物学会第十五届会员代表大会暨八十周年学术年会

会议日期:20131013

会议地点:中国江西南昌

主办单位:中国植物学会

出版日期:20131013

学会名称:中国植物学会

语  种:中文

摘  要:药用植物产量取决于初生代谢产物的积累,而质量取决于次生代谢产物的积累。高等植物通过光合作用合成并积累葡萄糖、蔗糖等,蔗糖降解后生成葡萄糖和果糖再经一系列转化,进一步合成萜类等次生物质。蔗糖代谢水平的高低直接关系果实的发育,并影响到产量,而萜类中的单萜和倍半萜则是药用植物阳春砂(Amomum villosum Lour.)的有效成分,是质量评价的重要指标。本研究首次采用Illumina HiSeq2000高通量测序平台获得阳春砂转录组5.9Gb的数据,并注释获得144020条Unigenes。采用COG功能分类将Unigenes划分为25个功能类别,涉及物质及能量代谢、信号转导、转录控制及生长发育等诸多生理生化过程。以转录组数据为参照,对阳春砂未成熟和成熟果实进行基于RNA-seq的表达谱测序分析,筛选到成熟果实中表达量显著上调的Unigenes2766条,下调的Unigenes6298条。对可溶性糖和萜类骨架合成的生物学过程进行KEGG代谢通路分析,获得淀粉及蔗糖代谢Unigenes84条、糖酵解Unigenes48条、萜类骨架合成过程Unigenes19条。蔗糖代谢过程中,参与蔗糖合成的关键酶是蔗糖磷酸合成酶(sucrose phosphate synthase,EC:2.4.1.14)、蔗糖合成酶(sucrose synthase,EC:2.4.1.13),参与蔗糖裂解的是转化酶(invertase,EC:3.2.1.26)。表达谱分析成熟果实中有差异表达的蔗糖磷酸合成酶Unigene1条,为上调,蔗糖合成酶Unigenes9条,均下调,转化酶Unigenes8条,5条上调,即蔗糖代谢以裂解为主。蔗糖裂解形成的果糖、葡萄糖,一部分需经糖酵解代谢途径。糖酵解过程三个不可逆的步骤,分别由己糖激酶(hexokinase,EC:2.7.1.1)、6-磷酸果糖激酶(6-phosphofructokinas,EC:2.7.1.11)及丙酮酸激酶(pyruvate kinase,EC:2.7.1.40)催化。成熟果实表达谱中2条6-磷酸果糖激酶Unigenes和6条丙酮酸激酶Unigenes上调。糖酵解产物3-磷酸甘油醛、丙酮酸及乙酰CoA是萜类物质合成的前体,上述酶�

关 键 词:阳春砂 果实发育 RNA-SEQ 表达谱 可溶性糖  萜类化合物

分 类 号:S567.239]

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引证文献:

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同被引文献:

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