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复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 收藏

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研究主题:药物    靶基因    RNA编辑    心脏发育    小鼠    

研究学科:生物科学类    

被引量:34H指数:2WOS: 1 北大核心: 11 CSSCI: 1 CSCD: 10

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13 条 记 录,以下是 1-10

中国城市人群孕期体重增加及其与新生儿出生体重的关系:一项多中心横断面研究
1
《复旦学报(医学版)》复旦大学附属妇产科医院产科;复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 梁嬛 沈婕 董欣然 李笑天  出版年:2016
国家卫生部卫生行业专项资金(201002013)~~
目的根据美国医学研究院(Institute of Medicine,IOM)2009年指南标准,调查中国人群低危孕产妇孕前体质指数(body mass index,BMI)和孕期体重增加(gestational weig...
关键词:出生体重 孕期体重增加 体质指数
基因功能富集分析的研究进展
2
《中国科学:生命科学》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系;复旦大学附属儿科医院 王潇 尹天舒 李柏逸 江熹霖 孙慧 窦亚光 倪琦 田卫东  出版年:2016
国家自然科学基金(批准号:91231116;31071113;30971643);国家重点基础研究发展计划(批准号:2012CB316505;2010CB529505)资助
基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段,对于揭示生物医学分子机制具有重要意义.目前已有上百种基因功能富集分析的方法和工具.根据所解决的问题和算法的原理,这些方法可大体分为过代表分析、功能集打分、基于通路拓扑...
关键词:组学数据  功能富集  冗余性 标准数据集  
阿尔茨海默症靶基因及其药物的预测研究
3
《复旦学报(自然科学版)》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系;上海出入境检验检疫局上海200135 侯吉 李小林 田卫东  出版年:2018
阿尔茨海默症(AD)是一种起病隐匿的进行性发展的神经系统退行性疾病.目前用于治疗AD的药物主要改善患者的认知功能,延缓疾病的进展.目前,这类药物的研制和开发方兴未艾,新药层出不穷.遗憾的是,几乎所有的药物都未能使患者广泛...
关键词:阿尔茨海默症 靶基因 功能富集分析  网络 预测  
初始编码及最大序列号均未知时总体容量的估计
4
《复旦学报(自然科学版)》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 李亚男 王昱泉 陈国蓝 胡跃清  出版年:2019
国家自然科学基金(11571082)
实际生活中,很多产品的序列号是连续的,估计出最大序列号就知道产品的总产量.例如二战中德军坦克数量的估计就是初始编码为1时最大序列号的估计.但在很多商业活动中,需要估计某产品在某个时间段的产量.本文研究这种初始编码及最大序...
关键词:序列号估计  极大似然估计 迭代估计  最小方差无偏估计
基于相关个体拷贝数变异数据的趋势检验及在孤独症数据中的应用
5
《复旦学报(自然科学版)》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 吕梦轩 王昱泉 胡跃清  出版年:2020
国家自然科学基金(11971117)。
拷贝数变异是人类基因组遗传多样性的重要组成部分,是当前的研究热点.然而相应的关联研究方法不多,尤其是个体有血缘关系时.本文基于相关个体,在Cochran-Armitage趋势检验的基础上,针对拷贝数变异数据是可基因分型和...
关键词:拷贝数变异 趋势检验  相关个体  孤独症 群体数据  
小鼠心脏发育中RNA编辑的动态变化及影响
6
《解剖学研究》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系;复旦大学附属金山医院心内科 彭瑛 张峰  出版年:2021
复旦大学附属金山医院青年科研启动基金(JYQN-JC-202010)。
目的探讨RNA编辑在小鼠心脏发育过程中的动态变化并对其功能影响进行分析预测。方法从ArrayExpress数据库获取小鼠心脏发育的转录组数据(E-MTAB-6798),使用SPRINT和ANNOVAR工具识别和注释RNA...
关键词:RNA编辑 心脏发育 转录组 腺苷脱氨酶
罕见变异关联分析中的统计方法研究进展
7
《数理统计与管理》南京林业大学理学院应用数学系;复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 朱德刚 刘应安 夏业茂 韩秋红  出版年:2017
南京林业大学青年科技创新基金(CX2015027);国家自然科学基金(11471161)的资助
二代测序数据的持续增多以及全基因组关联分析存在着只关注常见变异对表型影响的缺陷,使得研究人员开始考虑罕见变异对表型表达的影响。近年来,涉及罕见变异关联分析的统计方法研究成为一个活跃的领域,大批统计检验方法被相继提出。然而...
关键词:罕见变异  统计方法  全基因组关联分析 二代测序  综述  
调整协变量的多位点关联分析方法及其在酗酒数据中的应用
8
《复旦学报(自然科学版)》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 邓舒方 王昱泉 胡跃清  出版年:2021
国家自然科学基金(11971117)。
复杂疾病的发生与个体的遗传变异和环境协变量密切相关.在进行遗传位点与性状的关联分析时,环境协变量起着重要作用.如果处理它们的方法不当,可能会带来分析结果的偏差或是检验功效的降低.针对多位点遗传变异信息,我们在整合连锁不平...
关键词:多位点  关联分析  调整协变量  倾向得分  
一种基于基因组甲基化探针的肺腺癌诊断模型
9
《复旦学报(自然科学版)》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 窦亚光 田卫东  出版年:2017
教育部博士点专项科研基金(博导类)(20120071110018)
由于肺腺癌早期病征不够明显,传统的检测方法难以达到早期临床诊断的要求.目前,基于甲基化分子标记进行癌症的早期诊断则展现出很好的发展前景.本研究在训练集中筛选出在肺腺癌与正常样本中甲基化差异度最大的10个甲基化探针,并基于...
关键词:肺腺癌 早期诊断  甲基化 探针 广义线性模型 Lasso  
基于病例对照组的检验差异甲基化基因功能区域的方法
10
《复旦学报(自然科学版)》复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系 马欣宇 王婵 胡跃清  出版年:2017
国家自然科学基金(11571082;11171075)
DNA甲基化是一种重要的表观遗传学修饰,能够参与基因表达调控从而影响生理活动.在病例-对照组研究中,利用甲基化水平定位与疾病相关联的基因功能区域,有助于了解甲基化调控基因表达的机制,为后续研究提供疾病关联基因的线索.目前...
关键词:差异甲基化检验  亚硫酸氢盐测序  功能富集分析  
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